R metafor forest-plots:xlim似乎被错误地忽略了

时间:2016-02-26 10:04:50

标签: r

我在R包forest.rma中使用metafor。我想使用xlim参数来指定绘图的宽度。但是当其中一个x值超出该范围时,这会被覆盖。以下是两个例子:

library(metafor)
par(mfrow=c(2,1))
rmaObject <- rma.uni(yi=c(1.3, -16), sei=c(0.8, 0.7)) 
forest(rmaObject, atransf=exp, xlim=c(-5,12), alim=c(-5,12))$xlim
forest(rmaObject, atransf=exp, xlim=c(-5,12))$xlim

在这两种情况下,我认为该功能应遵循我的指示使用xlim=c(-5,12)并为第二个条形图画一个左箭头,以显示整个条形图位于图的左侧之外。但是,当控制台输出显示第一个设置xlimc(-16,12)时,第二个设置为c(-20,12)

换句话说,forest强制xlim完全包含两个条形图,但如果我指定xlim,我认为不应该这样做,尤其如果我指定alim 1}}。我有一个简单的方法可以解决这个问题吗?

这个例子中的数字是真实的,虽然我省略了我的大多数研究(即yisei的值),这些数据大多在0或1的范围内。

1 个答案:

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您可以按照此处所述安装metafor的开发版本:

http://www.metafor-project.org/doku.php/installation#development_version

它更好地处理这个问题。它仍然强制xlim包含yi值,但不再包含alim。底部的摘要多边形仍然看起来像废话(我没有内置任何代码来切断alim值的多边形形状 - 不像它看起来那么简单),但这可能不是一旦你添加了其余的研究,就会出现问题。