如何使用C ++ API在HDF5文件中创建多值属性

Question

编辑开始

我试图创建一对＆＃34;对，三元组或者n-uplet＆＃34;基于本机类型的属性（float，int ...）：

• 浮子，浮子的三重组，浮子的n-uplet属性
• int对，int的三元组，int属性的n-uplet

我没有尝试创建一个＆＃34;数组＆＃34;属性，我没有尝试创建一个＆＃34;化合物＆＃34;属性

编辑结束

我尝试根据本机类型（float，int ...）创建一个属性，但它包含2,3或更多值（相当于一对或一个n-uplet）。

我不想创建阵列！我想创建一个非常类似于数组的东西，但不是相同的

我可以通过这种方式创建单值属性（对于＆＃34; double＆＃34;属性）：

H5::DataSpace dataSpace = H5::DataSpace();
H5::Attribute attribute = group.createAttribute(attributeName, H5::PredType::IEEE_F64LE, dataSpace);
attribute.write(H5::PredType::IEEE_F64LE, &attributeValue);

为了创建一对＆＃34; double＆＃34;，我试过这个：

hsize_t dimension;
dimension = 2;
H5::ArrayType dataType(H5::PredType::IEEE_F64LE, 1, &dimension);

H5::DataSpace dataSpace = H5::DataSpace();
H5::Attribute attribute = group.createAttribute(attributeName, dataType, dataSpace);

double attributeValue[2];
attributeValue[0] = x;
attributeValue[1] = y;

attribute.write(dataType, attributeValue);

但它在HDF5文件中创建了数组类型属性。

我知道可以创建一个包含多个值的属性，因为我可以使用HDFView GUI软件（第一行使用上面的代码创建，第二行是使用GUI创建的属性） - 我想创建这种属性）：

任何帮助将不胜感激！

Answer 1

如果不知道自己要完成什么，我相信您正在寻找的是使用HDF5复合数据类型H5 :: CompType的自定义数据类型，它通常用于保存简单的结构。取自HDF5 C++ compound example page，结构

  typedef struct s1_t {
    int    a;
    float  b;
    double c;
  } s1_t;

具有关联的复合数据类型：

  CompType mtype1( sizeof(s1_t) );
  mtype1.insertMember( MEMBER1, HOFFSET(s1_t, a), PredType::NATIVE_INT);
  mtype1.insertMember( MEMBER3, HOFFSET(s1_t, c), PredType::NATIVE_DOUBLE);
  mtype1.insertMember( MEMBER2, HOFFSET(s1_t, b), PredType::NATIVE_FLOAT);

然后，以与本机数据类型相同的方式处理复合数据类型，也可以将其另存为属性。

修改

您在上面的代码中所犯的错误是定义您的数据类型，以便在您实际上不想保存数组时保存为H5 :: ArrayType。您真正想要的是保存在更高维数据空间中的简单数据类型（例如PredType :: NATIVE_DOUBLE）。

#include "H5Cpp.h"

#ifndef H5_NO_NAMESPACE
  using namespace H5;
#ifndef H5_NO_STD
  using std::cout;
  using std::endl;
#endif  // H5_NO_STD
#endif  
const H5std_string FILE_NAME("save.h5");
const H5std_string ATT_NAME("Attribute");

int main(){
  const hsize_t dims=5;
  int ndims=1;

  DataType dtype=PredType::NATIVE_DOUBLE;

  H5File h5file(FILE_NAME, H5F_ACC_TRUNC,H5P_DEFAULT,H5P_DEFAULT);

  DataSpace* dspace = new DataSpace(ndims,&dims);
  Attribute att=h5file.createAttribute(ATT_NAME,dtype,*dspace);
  delete dspace;

  double attvalue[dims];
  for(auto i=0;i<dims;++i) attvalue[i]=i;

  att.write(dtype,attvalue);
  h5file.close();

  return 0;
} 

这应该重现上面的“createdUsingHDFVIEW”属性（数据类型除外）。我无法检查以确保因为我没有HDFView。起初我没有想到这一点，因为我倾向于将H5 :: DataSpace视为一种类型的数组（实际上是它）。