Question

当我尝试将无符号long long属性添加到数据集时，会添加该属性，但不会添加该值。对整数使用类似的方法似乎工作文件。

使用HDF视图查看属性。将显示属性名称，但对于unsigned long long属性，值不可见

代码如下：

    herr_t Result;

//Open the file
hid_t DataFile = H5Fopen(FileName, H5F_ACC_RDWR, H5P_DEFAULT);

//Open the dataset
hid_t DataSet = H5Dopen2(DataFile, "/Summary", H5P_DEFAULT);

//Create the data space for the attribute.
hsize_t AttributeDims = 1;
hid_t AttributeDataSpace = H5Screate_simple(1, &AttributeDims , NULL);
hid_t Attribute;

//Attribute 1: Fail to write a long long attribute
Attribute = H5Acreate2 (DataSet, "LongAttribute",  H5T_STD_U64BE, AttributeDataSpace, H5P_DEFAULT, H5P_DEFAULT);
if (Attribute < 0) {
    fprintf(stdout, "Failed to add the unsigned long long attribute to the file %s.", FileName);
    return false;
}

//Write the attribute data
unsigned long long* ULLAttribute = (unsigned long long*) malloc(sizeof(unsigned long long) * 1);
ULLAttribute[0] = (unsigned long long) 4;
Result = H5Awrite(Attribute, H5T_NATIVE_ULLONG, ULLAttribute);
if (Result < 0) {
    fprintf(stdout, "Failed to write the unsigned long long attribute to the file %s.", FileName);
    return false;
}

//Attribute 2: Succesfully Write a integer attribute
Attribute = H5Acreate2 (DataSet, "IntAttribute",  H5T_STD_I32BE, AttributeDataSpace, H5P_DEFAULT, H5P_DEFAULT);
if (Attribute < 0) {
    fprintf(stdout, "Failed to create the attribute for the file %s.", FileName);
    return false;
}

//Write the attribute data
int32_t* IAttribute = (int32_t*) malloc(sizeof(int32_t) * 1);
IAttribute[0] = (int32_t) 4;
Result = H5Awrite(Attribute,  H5T_NATIVE_INT, IAttribute);
if (Result < 0) {
    fprintf(stdout, "Failed to add the integer attribute to the file %s.", FileName);
    return false;
}

//Close the attribute, Dataset and DataFile
Result = H5Aclose(Attribute);
Result = H5Dclose(DataSet);
Result = H5Fclose(DataFile);

执行代码时不会显示任何错误消息，但是当查看HDF5文件时，两个属性都会显示＆＃34; IntAttribute＆＃34;和＃34; LongAttribute＆＃34;是可见的，但LongAttribute没有价值。

HFView 2.9，英特尔64上的Fedora 20。

挑选蒂莫西的一些问题 WRT：你为什么要为属性创建一个简单的数据空间？我正在咀嚼将模型参数存储为属性，有点像键值对。许多模型参数都是简单的标量值。

WRT：按照相同的路线，你怎么写属性的数组？我编辑了一个示例，它在数组中存储了2个值。我从你的例子中看到，你是malloc（）的空间，从现在开始我将使用它，因为它似乎更清晰。

WRT：你在英特尔64上，但你想写大端？是的：这仍然让我感到困惑：H5T_STD_I32BE和H5T_STD_I32LE都成功运行，但H5T_STD_U64BE和H5T_STD_U64LE都没有在HDFView中显示值。我猜想在HDF5库的某个地方，无论参数如何，它都会检查大端与小端并相应地处理该值。我会尽量不去绊倒这个＆＃34;功能＆＃34;后来使用Postgresql二进制数，它们总是大端值。

问题似乎出现在HDFView中，它仍然没有在Timothy的代码生成的ull.h5文件中显示unsigned long long，或者从我的代码中显示： enter image description here

我正在使用HDFView 2.9 for Linux。正如蒂莫西提到的那样，在HDFView 2.10中我可以使用h5dump。

Answer 1

有几个问题，应该没问题，但我只是好奇。

为什么要为属性创建简单的数据空间？
按照相同的路线，你怎么写属性的数组？
你在英特尔64上，但你想写大端？

这是使用标量数据空间编写属性的简单示例：

#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <hdf5.h>

int
main(int argc, char **argv)
{
        unsigned long long *ull = NULL;
        hid_t f_id = {0};
        hid_t d_id = {0};
        hid_t s_id = {0};
        hid_t a_id = {0};
        hid_t as_id = {0};
        hsize_t dims[2] = {2, 2};
        herr_t status = {0};

        f_id = H5Fcreate("ull.h5",H5F_ACC_TRUNC, H5P_DEFAULT, H5P_DEFAULT);
        s_id = H5Screate_simple(2, dims, NULL);
        d_id = H5Dcreate(f_id, "/data", H5T_STD_I32BE, s_id,
                         H5P_DEFAULT, H5P_DEFAULT, H5P_DEFAULT);

        as_id = H5Screate(H5S_SCALAR);
        a_id = H5Acreate(d_id, "unsigned long long", H5T_STD_U64LE,
                         as_id, H5P_DEFAULT, H5P_DEFAULT);

        ull = malloc(sizeof(unsigned long long));
        *ull = 123;
        status = H5Awrite(a_id, H5T_NATIVE_ULLONG, ull);

        status = H5Aclose(a_id);
        status = H5Dclose(d_id);
        status = H5Sclose(s_id);
        status = H5Fclose(f_id);

        return(EXIT_SUCCESS);
}

编译并运行时：

h5pcc -o test test.c && ./test && h5dump ull.h5

我觉得很好：

HDF5 "ull.h5" {
GROUP "/" {
   DATASET "data" {
      DATATYPE  H5T_STD_I32BE
      DATASPACE  SIMPLE { ( 2, 2 ) / ( 2, 2 ) }
      DATA {
      (0,0): 0, 0,
      (1,0): 0, 0
      }
      ATTRIBUTE "unsigned long long" {
         DATATYPE  H5T_STD_U64LE
         DATASPACE  SCALAR
         DATA {
         (0): 1234
         }
      }
   }
}
}

当然，如果我将标量属性数据空间更改为一个简单的数据空间，它仍然可以工作：

as_id = H5Screate_simple(1, adims, NULL);
a_id = H5Acreate(d_id, "unsigned long long", H5T_STD_U64LE,
                 as_id, H5P_DEFAULT, H5P_DEFAULT);
ull = malloc(sizeof(unsigned long long));
*ull = 123;

我们得到：

  ATTRIBUTE "unsigned long long" {
     DATATYPE  H5T_STD_U64LE
     DATASPACE  SIMPLE { ( 1 ) / ( 1 ) }
     DATA {
     (0): 123
     }

这是一个长篇大论的例子之后，如何做到这一点。看看你的代码，我真的无法找到你的错误。事实上，在空的HDF5文件中使用您的代码可以正常工作：

localhost ~$ h5dump ull.h5
HDF5 "ull.h5" {
GROUP "/" {
   DATASET "Summary" {
      DATATYPE  H5T_STD_I32BE
      DATASPACE  SIMPLE { ( 2, 2 ) / ( 2, 2 ) }
      DATA {
      (0,0): 0, 0,
      (1,0): 0, 0
      }
   }
}
}
localhost ~$ ./foo
localhost ~$ h5dump ull.h5
HDF5 "ull.h5" {
GROUP "/" {
   DATASET "Summary" {
      DATATYPE  H5T_STD_I32BE
      DATASPACE  SIMPLE { ( 2, 2 ) / ( 2, 2 ) }
      DATA {
      (0,0): 0, 0,
      (1,0): 0, 0
      }
      ATTRIBUTE "IntAttribute" {
         DATATYPE  H5T_STD_I32BE
         DATASPACE  SIMPLE { ( 1 ) / ( 1 ) }
         DATA {
         (0): 4
         }
      }
      ATTRIBUTE "LongAttribute" {
         DATATYPE  H5T_STD_U64BE
         DATASPACE  SIMPLE { ( 1 ) / ( 1 ) }
         DATA {
         (0): 4
         }
      }
   }
}
}

您可以查看（并发布）h5dump给您的内容吗？也许这仅仅是使用HDFView？

<强>更新

我刚看了HDFView（版本2.10）的文件，看起来没问题。 HDFView inspection of Attributes

您可以确认/重新创建错误吗？

HDF5属性unsigned long long值

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