数据框中的订单功能有什么问题？

Question

DF <- data.frame(CpGId, tframe$t, tframe$p, q)
dimnames(DF)[[2]] <- c("CpGId", "t_value", "p_value", "q_value")
DFhyper <- DF[with(DF, q_value < 0.05 & t_value> 0), ]
DFhyper <- data.frame(DFhyper, row.names = NULL)
DFhyper <- DFhyper [order(p_value), ]

直到第四行代码，一切正常，但为什么R给出p_value object not found的错误？

Answer 1

需要

DFhyper <- DFhyper [order(Dfhyper$p_value), ]

Answer 2

R首先执行括号内的表达式，而不关注它将如何使用。当您键入

时

DFhyper[order(p_value),]

R将在当前范围（可能是全局范围）中查找p_value，但是，由于它绑定到数据框中，因此无法找到它。你需要做些什么来告诉它它的位置。

无论

DFhyper[order(DFhyper$p_value),]

或

DFhyper[with(DFhyper,order(p_value)),]

（或几乎相当于with(DFhyper,DFHyper[order(p_value),])）将起作用。第一个命令告诉R特别指出你正在引用数据框中的列，第二个命令告诉R在数据框中查找变量，如果它在范围内找不到它。

最后，您也可以将数据框绑定到范围中，执行

attach(DFhyper)
DFhyper[order(p_value),]

attach命令将dataframe列添加到当前范围。当您在dataframe列上有许多操作但不想继续引用它时，它会很有用。完成后，您可以使用detach(DFhyper) 分离。