Question

我在Windows 7上使用R Version R-3.2.3运行RStudio（0.99.878）。

当我尝试使用以下命令从bioconductor安装软件包时，收到错误消息：

源（＆＃34; http://bioconductor.org/biocLite.R＆＃34）      文件错误（文件名，＆＃34; r＆＃34;，编码=编码）：
       无法打开连接
     另外：警告信息：
     在文件中（文件名，＆＃34; r＆＃34;，编码=编码）：
       无法连接到＆＃39; bioconductor.org＆＃39;在80号港口。

我认为这是代理设置/防火墙的问题，但是在R中运行时完全相同的代码工作正常（它给了我一个警告（＆＃39; lib =＆＃34; C：/ Program Files / R / R-3.2.3 /库＆＃34;＆＃39;不可写），但询问我是否要将其保存在另一个文件夹中，然后就可以了。）

我尝试以管理员身份运行RStudio，我也取消选中＆＃34;使用Internet Explorer库/代理进行HTTP＆＃34;，因为这个问题在其他地方推荐这些步骤，但它没有帮助。 / p>

Answer 1

所以本地IT管理员就在这里，并且已经更改了RStudio的设置（右键单击RStudio - ＆gt;属性 - ＆gt; ...），这没有帮助。在尝试代码是否有效时，我从bioconductor网站上复制了它并且它有效：区别在于它在原始代码中使用http s 而不是http！

source("https://bioconductor.org/biocLite.R")

Answer 2

使用来下载文件时，我遇到同样的问题

> source("http://www.statmethods.net/RiA/wmc.txt")
Error in file(filename, "r", encoding = encoding) : 
  cannot open the connection
In addition: Warning message:
In file(filename, "r", encoding = encoding) :
  InternetOpenUrl failed: '安全频道支持出错'

然后我尝试

> options(download.file.method="libcurl", url.method="libcurl")
> source("http://www.statmethods.net/RiA/wmc.txt")
> wmc

有效

无法连接到bioconductor网站

2 个答案: