Question

从这个简单的数据框开始：

  node   t1   t2
0    a  pos  neg
1    b  neg  neg
2    c  neg  neg
3    d  pos  neg
4    e  neg  pos
5    f  pos  neg
6    g  neg  pos

我想构建一个edgelist文件，将其作为无向网络读取。预期的输出是：

b c
a d
a f
d f
e g

所以基本上，如果两个节点在['t1','t2']列中具有相同的值对，我就会将其链接起来。到目前为止，我首先尝试将值分组到一个新列中：

d['c'] = [tuple(i) for i in df[['t1','t2']].values]

但是我依旧按照自己的意愿对用户进行分组。

编辑：修复了创建新列时的错误。

Answer 1

看看这个：

df = pd.DataFrame({'node': ['a', 'b','c', 'd', 'e', 'f', 'g'],
               't1': ['pos', 'neg', 'neg', 'pos', 'neg', 'pos', 'neg'],
               't2': ['neg', 'neg', 'neg', 'neg', 'pos', 'neg', 'pos']})

K = nx.Graph()
K.add_nodes_from(df['node'].values)

# Create edges
for i, group in df.groupby(['t1', 't2'])['node']:
    # generate all combinations without replacement 
    # from the group of similar column pairs
    for u, v in itertools.combinations(group, 2):           
        K.add_edge(u, v)

print(K.edges())

结果：[（'a'，'d'），（'a'，'f'），（'c'，'b'），（'e'，'g'），（'d' ，'f'）]

这里的技巧是在pandas中同时按2列分组。然后，您可以创建要添加到图表中的所有边的组合。

pandas - 根据列值

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