ggplot意味着置信区间产生奇怪的输出

时间:2016-01-27 23:49:49

标签: r ggplot2

我有一些数据,我曾经在几个月前在ggplot中绘制没有问题,但现在它产生非常奇怪的输出。数据结构如下:

factor  time.step   run.number  total.tigers
0.25    0           1           128
0.25    1           1           129
0.25    2           1           134
...         
0.25    0           32          122
0.25    1           32          142
0.25    2           32          153
...         
1       0           32          152
1       1           32          137
1       2           32          158

换句话说,我从不同total.tigers级别(即0.25。,0.5,0.75,1)运行的模型输出factor。它们运行240 time.steps并复制32次(即run.number)。我很有兴趣在total.tigers上绘制time.steptotal.tigers对每个run.number级别的factor进行总结(平均值和置信区间)。

我的代码如下:

stat_sum_df <- function(fun, geom="crossbar", ...) {
  stat_summary(fun.data=fun, geom=geom, ...)
}

ggplot(data=finaldata.sub, 
       aes(x=time.step, y=total.tigers, color=factor, group=factor)) + 
  stat_sum_df("mean_cl_normal", geom = "smooth", size = 1) + xlab("Month") + ylab("Individuals") +
  scale_x_continuous(breaks = seq(0, 240, by=24)) 

但是,我不会在total.tigers中按顺序显示变化,而是会在time.steps之间产生锯齿形的输出。见图。 enter image description here

有关解决此问题的任何建议吗?

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