我在将Seaborn Jointplot
放入多列subplot
时遇到问题。
import pandas as pd
import seaborn as sns
df = pd.DataFrame({'C1': {'a': 1,'b': 15,'c': 9,'d': 7,'e': 2,'f': 2,'g': 6,'h': 5,'k': 5,'l': 8},
'C2': {'a': 6,'b': 18,'c': 13,'d': 8,'e': 6,'f': 6,'g': 8,'h': 9,'k': 13,'l': 15}})
fig = plt.figure();
ax1 = fig.add_subplot(121);
ax2 = fig.add_subplot(122);
sns.jointplot("C1", "C2", data=df, kind='reg', ax=ax1)
sns.jointplot("C1", "C2", data=df, kind='kde', ax=ax2)
注意如何只将jointplot
的一部分放置在子图内,其余部分留在另外两个图框内。我想要的是同时将distributions
插入subplots
内。
任何人都可以帮忙吗?
答案 0 :(得分:26)
没有黑客攻击就不容易做到。 jointplot
调用JointGrid
方法,每次调用时都会创建一个新的figure
对象。
因此,黑客攻击是制作两个联合图(JG1
JG2
),然后创建一个新图,然后将轴对象从JG1
JG2
迁移到新的人物创造。
最后,我们调整刚创建的新图中子图的大小和位置。
JG1 = sns.jointplot("C1", "C2", data=df, kind='reg')
JG2 = sns.jointplot("C1", "C2", data=df, kind='kde')
#subplots migration
f = plt.figure()
for J in [JG1, JG2]:
for A in J.fig.axes:
f._axstack.add(f._make_key(A), A)
#subplots size adjustment
f.axes[0].set_position([0.05, 0.05, 0.4, 0.4])
f.axes[1].set_position([0.05, 0.45, 0.4, 0.05])
f.axes[2].set_position([0.45, 0.05, 0.05, 0.4])
f.axes[3].set_position([0.55, 0.05, 0.4, 0.4])
f.axes[4].set_position([0.55, 0.45, 0.4, 0.05])
f.axes[5].set_position([0.95, 0.05, 0.05, 0.4])
这是一个黑客攻击,因为我们现在使用的是_axstack
和_add_key
个私有方法,这些方法可能会与现在matplotlib
未来版本中的方法保持一致。
答案 1 :(得分:25)
在matplotlib中移动轴并不像以前版本那样容易。以下是使用当前版本的matplotlib。
正如在几个地方(this question,还有this issue)所指出的,一些seaborn命令会自动创建自己的数字。这被硬编码到seaborn代码中,因此目前无法在现有数字中生成这样的图。这些是PairGrid
,FacetGrid
,JointGrid
,pairplot
,jointplot
和lmplot
。
有一个seaborn fork available允许向各个类提供子图网格,以便在预先存在的图中创建图。要使用它,您需要将axisgrid.py
从fork复制到seaborn文件夹。请注意,目前仅限于与matplotlib 2.1一起使用(也可能是2.0)。
另一种方法是创建一个seaborn图形并将轴复制到另一个图形。 this answer中显示了这一原则,可以扩展到Searborn情节。实现比我最初预期的要复杂一些。以下是可以使用seaborn网格实例(上述任何命令的返回),matplotlib图和SeabornFig2Grid
调用的类subplot_spec
,它是{{1}的位置网格。
gridspec
这个类的用法如下:
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.gridspec as gridspec
import seaborn as sns
import numpy as np
class SeabornFig2Grid():
def __init__(self, seaborngrid, fig, subplot_spec):
self.fig = fig
self.sg = seaborngrid
self.subplot = subplot_spec
if isinstance(self.sg, sns.axisgrid.FacetGrid) or \
isinstance(self.sg, sns.axisgrid.PairGrid):
self._movegrid()
elif isinstance(self.sg, sns.axisgrid.JointGrid):
self._movejointgrid()
self._finalize()
def _movegrid(self):
""" Move PairGrid or Facetgrid """
self._resize()
n = self.sg.axes.shape[0]
m = self.sg.axes.shape[1]
self.subgrid = gridspec.GridSpecFromSubplotSpec(n,m, subplot_spec=self.subplot)
for i in range(n):
for j in range(m):
self._moveaxes(self.sg.axes[i,j], self.subgrid[i,j])
def _movejointgrid(self):
""" Move Jointgrid """
h= self.sg.ax_joint.get_position().height
h2= self.sg.ax_marg_x.get_position().height
r = int(np.round(h/h2))
self._resize()
self.subgrid = gridspec.GridSpecFromSubplotSpec(r+1,r+1, subplot_spec=self.subplot)
self._moveaxes(self.sg.ax_joint, self.subgrid[1:, :-1])
self._moveaxes(self.sg.ax_marg_x, self.subgrid[0, :-1])
self._moveaxes(self.sg.ax_marg_y, self.subgrid[1:, -1])
def _moveaxes(self, ax, gs):
#https://stackoverflow.com/a/46906599/4124317
ax.remove()
ax.figure=self.fig
self.fig.axes.append(ax)
self.fig.add_axes(ax)
ax._subplotspec = gs
ax.set_position(gs.get_position(self.fig))
ax.set_subplotspec(gs)
def _finalize(self):
plt.close(self.sg.fig)
self.fig.canvas.mpl_connect("resize_event", self._resize)
self.fig.canvas.draw()
def _resize(self, evt=None):
self.sg.fig.set_size_inches(self.fig.get_size_inches())
请注意,复制轴可能存在一些缺点,而且上述内容尚未经过彻底测试。
答案 2 :(得分:1)
即使使用@ImportanceOfBeingErnest的优雅解决方案仍然遇到麻烦,您仍然可以将原始图作为图像保存到内存中,并使用它们来构建自定义图形。如果需要更高的分辨率,请使用“ .png”以外的其他格式。
以下是使用这种讨厌(但有效)的方法显示的示例:
import matplotlib.image as mpimg
import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns
# data
iris = sns.load_dataset("iris")
tips = sns.load_dataset("tips")
############### 1. CREATE PLOTS
# An lmplot
g0 = sns.lmplot(x="total_bill", y="tip", hue="smoker", data=tips,
palette=dict(Yes="g", No="m"))
# A PairGrid
g1 = sns.PairGrid(iris, hue="species")
g1.map(plt.scatter, s=5)
# A FacetGrid
g2 = sns.FacetGrid(tips, col="time", hue="smoker")
g2.map(plt.scatter, "total_bill", "tip", edgecolor="w")
# A JointGrid
g3 = sns.jointplot("sepal_width", "petal_length", data=iris,
kind="kde", space=0, color="g")
############### 2. SAVE PLOTS IN MEMORY TEMPORALLY
g0.savefig('g0.png')
plt.close(g0.fig)
g1.savefig('g1.png')
plt.close(g1.fig)
g2.savefig('g2.png')
plt.close(g2.fig)
g3.savefig('g3.png')
plt.close(g3.fig)
############### 3. CREATE YOUR SUBPLOTS FROM TEMPORAL IMAGES
f, axarr = plt.subplots(2, 2, figsize=(25, 16))
axarr[0,0].imshow(mpimg.imread('g0.png'))
axarr[0,1].imshow(mpimg.imread('g1.png'))
axarr[1,0].imshow(mpimg.imread('g3.png'))
axarr[1,1].imshow(mpimg.imread('g2.png'))
# turn off x and y axis
[ax.set_axis_off() for ax in axarr.ravel()]
plt.tight_layout()
plt.show()
答案 3 :(得分:0)
这是我的解决方案,您可以考虑覆盖类方法。无需复制和粘贴轴。
import seaborn as sns
class myjoint(sns.JointGrid):
def __init__(self, x, y, data=None,height=6, ratio=5, space=.2,
dropna=True, xlim=None, ylim=None, size=None):
super(myjoint, self).__init__(x, y, data,height, ratio, space,
dropna, xlim, ylim, size)
plt.close(2)
# Set up the subplot grid
self.ax_joint = f.add_subplot(gs[1:, :-1])
self.ax_marg_x = f.add_subplot(gs[0, :-1], sharex=self.ax_joint)
self.ax_marg_y = f.add_subplot(gs[1:, -1], sharey=self.ax_joint)
# Turn off tick visibility for the measure axis on the marginal plots
plt.setp(self.ax_marg_x.get_xticklabels(), visible=False)
plt.setp(self.ax_marg_y.get_yticklabels(), visible=False)
现在,您将能够绘制多个海洋联合图:
import matplotlib.gridspec as gridspec
import matplotlib.pyplot as plt
import pandas as pd
tips = sns.load_dataset("tips")
ratio = 3
f = plt.figure(figsize=(10,10))
outer_grid = gridspec.GridSpec(2, 2, wspace=0.3, hspace=0.3)
weekdays = ["Sun","Sat","Thur","Fri"]
for i,weekday in enumerate(weekdays):
tips[tips["day"]==weekday]
gs = gridspec.GridSpecFromSubplotSpec(ratio+1, ratio+1,
subplot_spec=outer_grid[i], wspace=0.3, hspace=0.3)
g = myjoint(x="total_bill", y="tip", data=tips, ratio=ratio)
g = g.plot(sns.regplot, sns.distplot)
f.tight_layout()
您可以在上面的代码片段中调整绘图行为,请注意,seaborn的默认样式不适合发布(它们在概率密度绘图上没有显示数字)。希望这对MLES班的学生也有所帮助。