我无法找到答案，所以我发布解决方案以防其他人遇到同样的问题。
使用Bioconductor的limma包，我遇到以下错误：
any(duplicated(rownames(matrix)))
不是一个非常有用的错误消息，但问题很简单。你＆＃34;矩阵＆＃34;的rownames不能有任何重复。用
检查any(duplicated(rownames(matrix)))
并在必要时重命名行。
答案 0 :(得分：1)
你的＆＃34;矩阵＆＃34;的rownames不能有任何重复。用
检查local d = tonumber(io.read()) or 0
并在必要时重命名行。
答案 1 :(得分：0)
limma包lmFit()函数确实会对基本chol2inv函数进行多次调用。
在我的Windows R3.2.5环境中更新了一些软件包后，在将矩阵对象传递给lmFit()函数时，我发生了类似的错误。安装R版本3.3.1（再次在Windows操作系统下）确实解决了这个问题：将矩阵对象传递给lmFit()（Limma 3.26.9）确实按预期返回MArrayLM个对象，没有“抱怨”来自chol2inv函数。
升级到R 3.3.1“头发中的错误”可能有望解决其他lmFit()问题。