多参数估计。广播问题

时间:2016-01-19 09:55:08

标签: python-3.x scipy least-squares numpy-broadcasting

我需要通过非线性最小二乘回归得到参数(kf,beta1,beta2,gamma)。 错误消息是: " ValueError:操作数无法与形状(4,7)(0,)和#34一起广播;

我在收集的下一个数据中做了4次实验:

  • flujo_ms(x轴数据):具有7个位置的数组
  • " fri":每个" fri"是一个由7个职位组成的数组。
  • brfv:取四个常数值,每个实验一个常数。

我想一起使用四个实验来最小化参数估计的误差。

import numpy as np
from scipy.optimize import leastsq

flux = [flujo_ms, flujo_ms, flujo_ms, flujo_ms]
brfv = [[0.00694] * 7, [0.00972] * 7, [0.0139] * 7, [0.0208]*7]
fr = [fr1, fr2, fr3, fr4]


def foulingRate(parameters, flux, brfv, mlts=8.22):
    kf, beta1, beta2, gamma = parameters
    FR = kf * np.exp(flux * (beta1 * brfv + beta2 * mlts + gamma))
    return FR


def objective(pars, yData, xData, brfv):
    # it will minimize this function
    err = yData - foulingRate(pars, xData, brfv)
    return err

x0 = [5.6 * 10 ** -4, -2.48 * 10 ** 8, 5.1 * 10 ** 4,
      2.81 * 10 ** 6]  # initial values for the parameters

plsq = leastsq(objective, x0, args=(fr, flux, brfv))
print("Fitted parameters = {0}".format(plsq[0]))

1 个答案:

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我找到了解决方案。我使用模块lmfit:cars9.uchicago.edu/software/python/lmfit