r修改并重建包

Question

我正在尝试使用SemiMarkov包，我想在那里更改一小段代码。我已经做了一些挖掘：

getAnywhere("semiMarkov")

＆安培;我已经确定要改变这一行：

hessian <- diag(ginv(hessian(V, solution)))

尝试类似的事情：

hessian <- diag(ginv(pracma::hessian(V, solution)))

我该如何解决这个问题？我是否需要从头开始重建软件包，如果是这样，我需要rTools等，或者是否有一个简单的解决方法（我是一个相关的R新手）？我做了一些在线搜索，找不到任何明显的东西。任何想法/指针都表示感激。

Answer 1

如果您只想在交互式R会话中测试该更改的效果，可以使用trace()进行测试。方法如下：

1. 输入trace("semiMarkov", edit=TRUE)
2. 在启动的文本编辑器中，编辑感兴趣的行。
3. 保存修改后的文件。
4. 关闭文本编辑器
5. 返回R，使用修改后的功能。

Answer 2

Linux环境

从CRAN下载包源开始。

• 这是着陆页：https://cran.r-project.org/web/packages/SemiMarkov/index.html
• 这是包来源：https://cran.r-project.org/src/contrib/SemiMarkov_1.4.2.tar.gz

下载并摘录来源：

wget https://cran.r-project.org/src/contrib/SemiMarkov_1.4.2.tar.gz
tar -xvzf SemiMarkov_1.4.2.tar.gz

这应该会产生一个名为SemiMarkov的目录。打开源（cd SemiMarkov），并根据需要进行修改。

接下来，构建更改：

cd ..
R CMD build SemiMarkov/

这将生成一个名为SemiMarkov_1.4.2.tar.gz的新存档文件。

最后，安装修改后的存档：

R CMD INSTALL SemiMarkov_1.4.2.tar.gz

Windows环境

我对Windows平台不太熟悉。 * nix工具在Cygwin中可用，但很痛苦。相反，正如Josh O＆Brien指出的那样，您应该遵循R安装和管理手册中的Windows-specific instructions。