解决方案

Question

我正在重建一个自定义R包，该包在其他库中，DESCRIPTION文件的Depends行中具有RcppArmadillo。

我正在运行R 3.5.1。在RStudio中重建软件包时，出现错误：

ERROR: dependency ‘RcppArmadillo’ is not available for package 'custom package name'

根据R Packages book，在重建软件包时，必须在Depends / Imports下安装软件包。

Answer 1

解决方案

改为使用devtools::install()。

说明

根据RStudio website，

Build and Reload命令依次执行几个步骤，以确保获得干净正确的结果：
  1.卸载程序包的任何现有版本（必要时包括共享库）。
  2.使用R CMD INSTALL构建并安装软件包。
  3.重新启动基础的R会话，以确保重新加载程序包的环境干净。
  4.通过执行库函数，在新的R会话中重新加载软件包。

devtools::install()将为您安装依赖项-来自help("install.packages")：

使用R CMD INSTALL安装软件包。还将尝试安装来自CRAN的软件包的依赖项（如果还没有的话）已安装。

（强调），单独使用R CMD INSTALL并不是这种情况（请参阅R中的?INSTALL或命令行中的R CMD INSTALL --help等）–没有提及需要安装依赖性）。

因此，出现了语言

事实上，无论何时安装软件包，如果还不存在，请安装在您的计算机上（devtools :: load_all（）还会检查软件包是否已安装）。

哈德利（Hadley）的R Packages中的

有点具体；它与使用R CMD INSTALL（RStudio的构建函数显然使用的）无关，但确实适用于devtools::install()。这是个人喜好问题，但老实说，我强烈建议您在软件包开发工作流程中使用devtools。

示例

我通过以下方式从系统中删除了软件包rbenchmark

remove.packages("rbenchmark")

然后通过创建一个虚拟包

devtools::create("SOexample", rstudio = FALSE)

并编辑了DESCRIPTION，将rbenchmark放入了导入，以便SOexample依赖于它。我在R/hello_world.R中添加了以下代码：

hello_world <- function() print("Hello, world!")

我尝试了R CMD INSTALL，但收到了错误消息

*安装到库‘/home/duckmayr/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.5’
  错误：依赖性“ rbenchmark”不适用于软件包“ SOexample”
  *删除“ /home/duckmayr/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.5/SOexample”

但是，如果我尝试devtools::install()：

> devtools::install("SOexample/")
Installing SOexample
trying URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/rbenchmark_1.0.0.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 5093 bytes
==================================================
downloaded 5093 bytes

Installing rbenchmark
'/usr/lib/R/bin/R' --no-site-file --no-environ --no-save --no-restore --quiet  \
  CMD INSTALL '/tmp/RtmpA0NOMe/devtools723832018149/rbenchmark'  \
  --library='/home/duckmayr/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.5' --install-tests 

* installing *source* package ‘rbenchmark’ ...
** package ‘rbenchmark’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** R
** demo
** byte-compile and prepare package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** testing if installed package can be loaded
* DONE (rbenchmark)
'/usr/lib/R/bin/R' --no-site-file --no-environ --no-save --no-restore --quiet  \
  CMD INSTALL '/home/duckmayr/SOexample'  \
  --library='/home/duckmayr/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.5' --install-tests 

* installing *source* package ‘SOexample’ ...
** R
** byte-compile and prepare package for lazy loading
** help
No man pages found in package  ‘SOexample’ 
*** installing help indices
** building package indices
** testing if installed package can be loaded
* DONE (SOexample)

重建自定义R软件包时

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