切割树的单链接层次聚类方法

Question

我的数据集包含3个类别{c1，c2和c3}。我正在使用单链接层次聚类方法（来自matlab）来聚类数据集。我建立了自己的距离测量。下图显示了结果。注意，层次聚类方法正确地聚类数据;其中c1（黄色）的点非常接近。类似地，c2（绿色）和c3（蓝色）。

从图中可以看出，与c2和c3相比，c1中各点之间的距离非常小。因此，例如，如果我决定在8处切割树，这将导致c1，c2和c3将被分割成8个簇;每个点将在不同的集群中。

我怎样才能克服这个问题;我需要更改聚类方法吗？或者在17处砍树并再次聚类生成的簇？

Answer 1

从树形图中提取簇有不同的方法。您不需要进行单一切割（尽管matlab可能只提供此选择）。选择像你这样的区域也是合理的，因此在多个高度处切割树形图。但并非每种工具都具备所有功能。

请注意，c3被分成两部分，其中一半与c2没有很好的分离。