使用R和plot.ly - 如何将输出脚本保存为网页

Question

我想使用R和plot.ly制作一些交互式图表。当我在R-Studio中运行以下代码时，它会生成一个交互式图形。

library(plotly)
set.seed(100)
d <- diamonds[sample(nrow(diamonds), 1000), ]
plot_ly(d, x = carat, y = price, text = paste("Clarity: ", clarity),
    mode = "markers", color = carat, size = carat)

生成此图表后，当我点击＆＃34;导出＆＃34;在R-Studio的Plot窗口中的按钮，它为我提供了将绘图保存为网页的选项。如何编写将生成的图表保存为网页的过程？我的最终目标是从bash脚本中迭代运行Rscripts以生成多个网页。

Answer 1

将plot_ly对象分配给变量，然后使用htmlwidgets::saveWidget()保存实际文件，如下所示：

library(plotly)
set.seed(100)
d <- diamonds[sample(nrow(diamonds), 1000), ]
p <- plot_ly(d, x = carat, y = price, text = paste("Clarity: ", clarity),
             mode = "markers", color = carat, size = carat)
htmlwidgets::saveWidget(as_widget(p), "index.html")

Answer 2

为R-3.5.1和plotly-4.8.0更新Andrew的answer，即：

library(plotly)
set.seed(100)
d <- diamonds[sample(nrow(diamonds), 1000), ]
p <- plot_ly(d, x = ~carat, y = ~price, text=~paste("Clarity : ", clarity))
htmlwidgets::saveWidget(as_widget(p), "index.html")

要将此内容移至work，还需要安装pandoc。在CentOS / RedHat上执行yum install pandoc pandoc-citeproc。在Mac OSX上，使用homebrew，执行brew install pandoc。

该解决方案已经过测试，可在R-3.5.1的OSX 10.13.6上运行。