如何将r函数作为R脚本运行？

Question

我有一个名为function_test的函数保存为testcode.r文件。 我一直在运行它（包含R环境中的所有必需参数）：

function_test(p1, p2 , p3 , p4)

在linux终端中如何运行它需要做什么？

Rscript testcode.r \

–p1 param1 \

–p2 param2  \

–p3 param3 \

--p4 param4 

Answer 1

试试这个：

在函数定义开始之前，将其作为函数文件的第一行添加：

args=commandArgs(trailingOnly = TRUE)

取决于您的函数所需的参数数量：

function_test(param1=args[2],param2=args[3],param3=args[4],param4=args[5])

args向量将您从命令行传递的所有内容存储为一个字符，因此如果您的函数期望对象为numeric，则可能必须进行类型转换。

然后从命令行调用脚本，如下所示：

Rscript testcode.r --args arg1 arg2 arg3 arg4