我试图为"逻辑和"创建一个简单的多层感知器(MLP)。在Theano。 输入和输出之间有一层。结构如下:
2值输入 - >乘以权重,增加偏差 - > softmax - > 1值输出
尺寸的变化是由权重矩阵引起的。
实施基于本教程:http://deeplearning.net/tutorial/logreg.html
这是我的Layer类:
class Layer():
"""
this is a layer in the mlp
it's not meant to predict the outcome hence it does not compute a loss.
apply the functions for negative log likelihood = cost on the output of the last layer
"""
def __init__(self, input, n_in, n_out):
self.W = theano.shared(
value=numpy.zeros(
(n_in, n_out),
dtype=theano.config.floatX
),
name="W",
borrow=True
)
self.b = theano.shared(
value=numpy.zeros((n_in
, n_out),
dtype=theano.config.floatX),
name="b",
borrow=True
)
self.output = T.nnet.softmax(T.dot(input, self.W) + self.b)
self.params = (self.W, self.b)
self.input = input
该课程是模块化的。我希望能够添加多个图层,而不仅仅是一个图层。 因此,预测,成本和错误的功能都在课堂之外(与教程相反):
def y_pred(output):
return T.argmax(output, axis=1)
def negative_log_likelihood(output, y):
return -T.mean(T.log(output)[T.arange(y.shape[0]), y])
def errors(output, y):
# check if y has same dimension of y_pred
if y.ndim != y_pred(output).ndim:
raise TypeError(
'y should have the same shape as self.y_pred',
('y', y.type, 'y_pred', y_pred(output).type)
)
# check if y is of the correct datatype
if y.dtype.startswith('int'):
# the T.neq operator returns a vector of 0s and 1s, where 1
# represents a mistake in prediction
return T.mean(T.neq(y_pred(output), y))
else:
raise NotImplementedError()
合乎逻辑且有4个培训课程:
以下是分类器的设置以及培训和评估的功能:
data_x = numpy.matrix([[0, 0],
[1, 0],
[0, 1],
[1, 1]])
data_y = numpy.array([0,
0,
0,
1])
train_set_x = theano.shared(numpy.asarray(data_x,
dtype=theano.config.floatX),
borrow=True)
train_set_y = T.cast(theano.shared(numpy.asarray(data_y,
dtype=theano.config.floatX),
borrow=True),"int32")
x = T.vector("x",theano.config.floatX) # data
y = T.ivector("y") # labels
classifier = Layer(input=x, n_in=2, n_out=1)
cost = negative_log_likelihood(classifier.output, y)
g_W = T.grad(cost=cost, wrt=classifier.W)
g_b = T.grad(cost=cost, wrt=classifier.b)
index = T.lscalar()
learning_rate = 0.15
updates = [
(classifier.W, classifier.W - learning_rate * g_W),
(classifier.b, classifier.b - learning_rate * g_b)
]
train_model = theano.function(
inputs=[index],
outputs=cost,
updates=updates,
givens={
x: train_set_x[index],
y: train_set_y[index]
}
)
validate_model = theano.function(
inputs=[index],
outputs=classifier.errors(y),
givens={
x: train_set_x[index],
y: train_set_y[index]
}
)
我试图遵循惯例。数据矩阵中的每一行都是训练样本。每个训练样本都与正确的输出相匹配。 不幸的是代码中断了。我无法解释错误消息。我做错了什么 ? 错误:
TypeError:无法将Type TensorType(int32,标量)(Variable Subtensor {int64} .0)转换为Type TensorType(int32,vector)。您可以尝试手动将Subtensor {int64} .0转换为TensorType(int32,vector)。
此错误发生在Theano代码的深处。我程序中的冲突行是:
train_model = theano.function(
inputs=[index],
outputs=cost,
updates=updates,
givens={
x: train_set_x[index],
y: train_set_y[index] # <---------------HERE
}
)
显然,y的维度与训练数据之间存在不匹配。 我在pastebin上的完整代码:http://pastebin.com/U5jYitk2 有关pastebin的完整错误消息:http://pastebin.com/hUQJhfNM
简明扼要的问题: 将训练数据提供给theano中的mlp的正确方法是什么? 我的错误在哪里?
我复制了本教程的大部分代码。值得注意的变化(错误的可能原因)是:
更新 我使用了Amir的代码。看起来很好,谢谢。
但它也会造成错误。最后一个循环超出范围:
/usr/bin/python3.4 /home/lhk/programming/sk/mlp/mlp/Layer.py Traceback (最近一次调用最后一次):文件 &#34; /usr/local/lib/python3.4/dist-packages/theano/compile/function_module.py" ;, 第595行,通话 outputs = self.fn()ValueError:y_i值超出范围
在处理上述异常期间,发生了另一个异常:
Traceback(最近一次调用最后一次):文件 &#34; /home/lhk/programming/sk/mlp/mlp/Layer.py" ;,第113行,在 train_model(i)File&#34; /usr/local/lib/python3.4/dist-packages/theano/compile/function_module.py", 第606行,在电话中 storage_map = self.fn.storage_map)文件&#34; /usr/local/lib/python3.4/dist-packages/theano/gof/link.py" ;,第206行, 在raise_with_op中 raise exc_type(exc_value).with_traceback(exc_trace)File&#34; /usr/local/lib/python3.4/dist-packages/theano/compile/function_module.py", 第595行,通话 outputs = self.fn()ValueError:y_i value out of bounds应用导致错误的节点:CrossentropySoftmaxArgmax1HotWithBias(Dot22.0, b,Elemwise {Cast {int32}}。0)输入类型:[TensorType(float64, 矩阵),TensorType(float64,vector),TensorType(int32,vector)] 输入形状:[(1,1),(1,),(1,)]输入步幅:[(8,8),(8,), (4,)]输入值:[array([[0.]]),array([0.]),array([1], D型= INT32)]
提示:禁用大多数Theano优化重新运行可以给你 创建此节点时的反向跟踪。这可以通过 设置Theano标志&#39; optimizer = fast_compile&#39;。如果没有 工作,可以使用&#39; optimizer = None&#39;禁用Theano优化。 提示:使用Theano标志&#39; exception_verbosity = high&#39;用于调试印刷 此应用节点的存储映射占用空间。
第113行是这一行:
#train the model
for i in range(train_set_x.shape[0].eval()):
train_model(i) # <-----------------HERE
我认为这是因为培训数据的索引使用了index
和index+1
。为什么这有必要?一行应该是一个训练样本。一行是train_set_x[index]
编辑:我调试了代码。没有切片,它返回一个1d阵列,切片2d。 1d应该与矩阵x不兼容。
但是当我这样做时,我发现了另一个奇怪的问题: 我添加了此代码来查看培训的效果:
print("before")
print(classifier.W.get_value())
print(classifier.b.get_value())
for i in range(3):
train_model(i)
print("after")
print(classifier.W.get_value())
print(classifier.b.get_value())
before
[[ 0.]
[ 0.]]
[ 0.]
after
[[ 0.]
[ 0.]]
[ 0.]
这是有道理的,因为前三个样本的正确输出为0。 如果我改变顺序并将训练样本(1,1),1移到前面,程序就会崩溃。
之前[[0.] [0.]] [0.] Traceback(最近一次调用最后一次):文件 &#34; /usr/local/lib/python3.4/dist-packages/theano/compile/function_module.py" ;, 第595行,通话 outputs = self.fn()ValueError:y_i值超出范围
在处理上述异常期间,发生了另一个异常:
Traceback(最近一次调用最后一次):文件 &#34; /home/lhk/programming/sk/mlp/mlp/Layer.py" ;,第121行,在 train_model(i)File&#34; /usr/local/lib/python3.4/dist-packages/theano/compile/function_module.py", 第606行,在电话中 storage_map = self.fn.storage_map)文件&#34; /usr/local/lib/python3.4/dist-packages/theano/gof/link.py" ;,第206行, 在raise_with_op中 raise exc_type(exc_value).with_traceback(exc_trace)File&#34; /usr/local/lib/python3.4/dist-packages/theano/compile/function_module.py", 第595行,通话 outputs = self.fn()ValueError:y_i value out of bounds应用导致错误的节点:CrossentropySoftmaxArgmax1HotWithBias(Dot22.0, b,Elemwise {Cast {int32}}。0)输入类型:[TensorType(float64, 矩阵),TensorType(float64,vector),TensorType(int32,vector)] 输入形状:[(1,1),(1,),(1,)]输入步幅:[(8,8),(8,), (4,)]输入值:[array([[0.]]),array([0.]),array([1], D型= INT32)]
提示:禁用大多数Theano优化重新运行可以给你 创建此节点时的反向跟踪。这可以通过 设置Theano标志&#39; optimizer = fast_compile&#39;。如果没有 工作,可以使用&#39; optimizer = None&#39;禁用Theano优化。 提示:使用Theano标志&#39; exception_verbosity = high&#39;用于调试印刷 此应用节点的存储映射占用空间。
更新
我在Theano上安装了Python2.7并尝试再次运行代码。发生同样的错误。我添加了详细的异常处理。这是输出:
/usr/bin/python2.7 /home/lhk/programming/sk/mlp/mlp/Layer.py
Traceback (most recent call last):
File "/home/lhk/programming/sk/mlp/mlp/Layer.py", line 113, in <module>
train_model(i)
File "/home/lhk/.local/lib/python2.7/site-packages/theano/compile/function_module.py", line 595, in __call__
outputs = self.fn()
File "/home/lhk/.local/lib/python2.7/site-packages/theano/gof/link.py", line 485, in streamline_default_f
raise_with_op(node, thunk)
File "/home/lhk/.local/lib/python2.7/site-packages/theano/gof/link.py", line 481, in streamline_default_f
thunk()
File "/home/lhk/.local/lib/python2.7/site-packages/theano/gof/op.py", line 768, in rval
r = p(n, [x[0] for x in i], o)
File "/home/lhk/.local/lib/python2.7/site-packages/theano/tensor/nnet/nnet.py", line 896, in perform
nll[i] = -row[y_idx[i]] + m + numpy.log(sum_j)
IndexError: index 1 is out of bounds for axis 0 with size 1
Apply node that caused the error: CrossentropySoftmaxArgmax1HotWithBias(Dot22.0, b, Subtensor{int32:int32:}.0)
Inputs types: [TensorType(float64, matrix), TensorType(float64, vector), TensorType(int32, vector)]
Inputs shapes: [(1, 1), (1,), (1,)]
Inputs strides: [(8, 8), (8,), (4,)]
Inputs values: [array([[ 0.]]), array([ 0.]), array([1], dtype=int32)]
Debugprint of the apply node:
CrossentropySoftmaxArgmax1HotWithBias.0 [@A] <TensorType(float64, vector)> ''
|Dot22 [@B] <TensorType(float64, matrix)> ''
| |Subtensor{int32:int32:} [@C] <TensorType(float64, matrix)> ''
| | |<TensorType(float64, matrix)> [@D] <TensorType(float64, matrix)>
| | |ScalarFromTensor [@E] <int32> ''
| | | |<TensorType(int32, scalar)> [@F] <TensorType(int32, scalar)>
| | |ScalarFromTensor [@G] <int32> ''
| | |Elemwise{add,no_inplace} [@H] <TensorType(int32, scalar)> ''
| | |<TensorType(int32, scalar)> [@F] <TensorType(int32, scalar)>
| | |TensorConstant{1} [@I] <TensorType(int8, scalar)>
| |W [@J] <TensorType(float64, matrix)>
|b [@K] <TensorType(float64, vector)>
|Subtensor{int32:int32:} [@L] <TensorType(int32, vector)> ''
|Elemwise{Cast{int32}} [@M] <TensorType(int32, vector)> ''
| |<TensorType(float64, vector)> [@N] <TensorType(float64, vector)>
|ScalarFromTensor [@E] <int32> ''
|ScalarFromTensor [@G] <int32> ''
CrossentropySoftmaxArgmax1HotWithBias.1 [@A] <TensorType(float64, matrix)> ''
CrossentropySoftmaxArgmax1HotWithBias.2 [@A] <TensorType(int32, vector)> ''
HINT: Re-running with most Theano optimization disabled could give you a back-trace of when this node was created. This can be done with by setting the Theano flag 'optimizer=fast_compile'. If that does not work, Theano optimizations can be disabled with 'optimizer=None'.
Process finished with exit code 1
更新
我再次查看了训练数据。任何带有1作为标签的样本都会产生上述错误。
data_y = numpy.array([1,
1,
1,
1])
对于(0,1,2,3)中的i,上述样本标签将针对每个train_model(i)崩溃。 显然,样本索引与样本内容之间存在干扰。
更新 确实,就像Amir的联系人指出的那样,问题是输出层的尺寸。我有一种误解,我可以训练网络对函数的输出进行编码&#34;逻辑和&#34;直接在输出神经元中。虽然这当然是可能的,但这种训练方法使用y值索引来选择应具有最高值的输出节点。将输出大小更改为2后,代码可以正常工作。通过足够的培训,所有案例的错误确实都变为零。
答案 0 :(得分:1)
以下是您的问题的工作代码。你的代码中有很多小错误。导致您遇到错误的原因是由于b
被n_in
矩阵定义为n_out
,而不是简单地将其定义为'n_out'向量。更新部分在括号[]
中定义,而不是括号()
。
此外,索引被定义为int32
符号标量(这不是很重要)。另一个导入更改是在给定正确索引的情况下定义函数。您使用index
编译函数的方式不会让函数由于某种原因进行编译。您还将输入声明为向量。这样,您将无法使用小批量或完整批次来训练模型。因此将其声明为符号矩阵是安全的。要使用向量,您需要将输入存储为向量而不是共享变量上的矩阵,以使程序运行。因此,会有这样的头痛将其声明为矢量。最后,您已使用classifier.errors(y)
编译验证函数,尽管您已从errors
类中删除了函数Layer
。
import theano
import theano.tensor as T
import numpy
class Layer(object):
"""
this is a layer in the mlp
it's not meant to predict the outcome hence it does not compute a loss.
apply the functions for negative log likelihood = cost on the output of the last layer
"""
def __init__(self, input, n_in, n_out):
self.x = input
self.W = theano.shared(
value=numpy.zeros(
(n_in, n_out),
dtype=theano.config.floatX
),
name="W",
borrow=True
)
self.b = theano.shared(
value=numpy.zeros(n_out,
dtype=theano.config.floatX),
name="b",
borrow=True
)
self.output = T.nnet.softmax(T.dot(self.x, self.W) + self.b)
self.params = [self.W, self.b]
self.input = input
def y_pred(output):
return T.argmax(output, axis=1)
def negative_log_likelihood(output, y):
return -T.mean(T.log(output)[T.arange(y.shape[0]), y])
def errors(output, y):
# check if y has same dimension of y_pred
if y.ndim != y_pred(output).ndim:
raise TypeError(
'y should have the same shape as self.y_pred',
('y', y.type, 'y_pred', y_pred(output).type)
)
# check if y is of the correct datatype
if y.dtype.startswith('int'):
# the T.neq operator returns a vector of 0s and 1s, where 1
# represents a mistake in prediction
return T.mean(T.neq(y_pred(output), y))
else:
raise NotImplementedError()
data_x = numpy.matrix([[0, 0],
[1, 0],
[0, 1],
[1, 1]])
data_y = numpy.array([0,
0,
0,
1])
train_set_x = theano.shared(numpy.asarray(data_x,
dtype=theano.config.floatX),
borrow=True)
train_set_y = T.cast(theano.shared(numpy.asarray(data_y,
dtype=theano.config.floatX),
borrow=True),"int32")
x = T.matrix("x") # data
y = T.ivector("y") # labels
classifier = Layer(input=x, n_in=2, n_out=1)
cost = negative_log_likelihood(classifier.output, y)
g_W = T.grad(cost=cost, wrt=classifier.W)
g_b = T.grad(cost=cost, wrt=classifier.b)
index = T.iscalar()
learning_rate = 0.15
updates = (
(classifier.W, classifier.W - learning_rate * g_W),
(classifier.b, classifier.b - learning_rate * g_b)
)
train_model = theano.function(
inputs=[index],
outputs=cost,
updates=updates,
givens={
x: train_set_x[index:index + 1],
y: train_set_y[index:index + 1]
}
)
validate_model = theano.function(
inputs=[index],
outputs=errors(classifier.output, y),
givens={
x: train_set_x[index:index + 1],
y: train_set_y[index:index + 1]
}
)
#train the model
for i in range(train_set_x.shape[0].eval()):
train_model(i)
以下是更新后的代码。请注意,上面的代码与下面的代码之间的主要区别在于,后者适用于二进制问题,而另一个仅在您遇到多类问题时才有效,而在此情况并非如此。我在这里放两个代码片段的原因是出于教育目的。请阅读评论以了解上述代码的问题以及我如何解决它。
import theano
import theano.tensor as T
import numpy
class Layer(object):
"""
this is a layer in the mlp
it's not meant to predict the outcome hence it does not compute a loss.
apply the functions for negative log likelihood = cost on the output of the last layer
"""
def __init__(self, input, n_in, n_out):
self.x = input
self.W = theano.shared(
value=numpy.zeros(
(n_in, n_out),
dtype=theano.config.floatX
),
name="W",
borrow=True
)
self.b = theano.shared(
value=numpy.zeros(n_out,
dtype=theano.config.floatX),
name="b",
borrow=True
)
self.output = T.reshape(T.nnet.sigmoid(T.dot(self.x, self.W) + self.b), (input.shape[0],))
self.params = [self.W, self.b]
self.input = input
def y_pred(output):
return output
def negative_log_likelihood(output, y):
return T.mean(T.nnet.binary_crossentropy(output,y))
def errors(output, y):
# check if y has same dimension of y_pred
if y.ndim != y_pred(output).ndim:
raise TypeError(
'y should have the same shape as self.y_pred',
('y', y.type, 'y_pred', y_pred(output).type)
)
# check if y is of the correct datatype
if y.dtype.startswith('int'):
# the T.neq operator returns a vector of 0s and 1s, where 1
# represents a mistake in prediction
return T.mean(T.neq(y_pred(output), y))
else:
raise NotImplementedError()
data_x = numpy.matrix([[0, 0],
[1, 0],
[0, 1],
[1, 1]])
data_y = numpy.array([0,
0,
0,
1])
train_set_x = theano.shared(numpy.asarray(data_x,
dtype=theano.config.floatX),
borrow=True)
train_set_y = T.cast(theano.shared(numpy.asarray(data_y,
dtype=theano.config.floatX),
borrow=True),"int32")
x = T.matrix("x") # data
y = T.ivector("y") # labels
classifier = Layer(input=x, n_in=2, n_out=1)
cost = negative_log_likelihood(classifier.output, y)
g_W = T.grad(cost=cost, wrt=classifier.W)
g_b = T.grad(cost=cost, wrt=classifier.b)
index = T.iscalar()
learning_rate = 0.15
updates = (
(classifier.W, classifier.W - learning_rate * g_W),
(classifier.b, classifier.b - learning_rate * g_b)
)
train_model = theano.function(
inputs=[index],
outputs=cost,
updates=updates,
givens={
x: train_set_x[index:index+1],
y: train_set_y[index:index+1]
}
)
validate_model = theano.function(
inputs=[index],
outputs=errors(classifier.output, y),
givens={
x: train_set_x[index:index + 1],
y: train_set_y[index:index + 1]
}
)
#train the model
for i in range(train_set_x.shape[0].eval()):
train_model(i)
答案 1 :(得分:0)
您可以尝试我的MLP课程:
基于Lasagne / Theano的MultiLayer Perceptron MLP,它接受稀疏和密集的输入矩阵,并且非常易于使用scikit-learn api相似性。
它具有退出可配置/稀疏输入/可以更改为逻辑回归,易于更改成本函数和l1 / l2 / elasticnet规则化。
代码为here