nlme和lme4中的不同随机效应

时间:2015-12-16 08:45:00

标签: r lme4 nlme

我在nlme

中使用此模型
library(nlme)
data("Machines")
fit1 <- lme(score ~  - 1 + Machine, random=~1|Worker, data=Machines)

我可以用

获得系数
> fit1$coefficients
$fixed
MachineA MachineB MachineC 
52.35556 60.32222 66.27222 

$random
$random$Worker
  (Intercept)
6 -8.70711058
2 -1.59425968
4 -0.06931564
1  1.21035769
3  6.21174760
5  2.94858062

现在我在lme4

中使用相同的模型
library(lme4)
fit2 <- lmer(score ~  -1 + Machine + (1|Worker), data=Machines)

我得到完全相同的固定效果:

 >summary(fit2)
 ...
 Fixed effects:
          Estimate Std. Error t value
 MachineA   52.356      2.229   23.48
 MachineB   60.322      2.229   27.06
 MachineC   66.272      2.229   29.73
 ...

我现在想要每个工人的随机效果,它们不会显示在摘要中,但必须是这样:

 > fit2@u
 [1] -5.34898187 -0.97939105 -0.04258222  0.74355106  3.81602197    1.81138210

为什么它们与nlme结果不同,而固定效果是相同的?

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

使用ranef()提取随机效果。

library(lme4)
library(nlme)
data("Machines")

fit1 <- lme(score ~  - 1 + Machine, random=~1|Worker, data=Machines)
ranef(fit1)

fit2 <- lmer(score ~  -1 + Machine + (1|Worker), data=Machines)
ranef(fit2)