Question

所以我的数据看起来像这样

chr1    169845117   169845232   -   ENSG00000000457.9_exNb11
chr1    169847773   169847960   -   ENSG00000000457.9_exNb12
chr1    169771760   169771866   +   ENSG00000000460.12_exNb4
chr1    169772308   169772450   +   ENSG00000000460.12_exNb5
chr6    41046766    41046903    +   ENSG00000001167.10_exNb2
chr6    41051783    41051931    +   ENSG00000001167.10_exNb4
chr6    41057316    41057449    +   ENSG00000001167.10_exNb5
chr6    41057941    41058048    +   ENSG00000001167.10_exNb6
chr6    41059265    41059433    +   ENSG00000001167.10_exNb7
chr6    41060649    41060824    +   ENSG00000001167.10_exNb8
chr6    41062133    41062236    +   ENSG00000001167.10_exNb9
chr6    46097728    46097926    +   ENSG00000001561.6_exNb1

我想删除第5列中exNb字符串末尾的行，例如上面的最后一行。可能有一个awk或sed选项可以让我这样做，但由于我对这两种语言都没有经验，我希望有人可以帮助我，我不确定这有多复杂。

编辑：所需的结果如下

chr1    169845117   169845232   -   ENSG00000000457.9_exNb11
chr1    169847773   169847960   -   ENSG00000000457.9_exNb12
chr1    169771760   169771866   +   ENSG00000000460.12_exNb4
chr1    169772308   169772450   +   ENSG00000000460.12_exNb5
chr6    41046766    41046903    +   ENSG00000001167.10_exNb2
chr6    41051783    41051931    +   ENSG00000001167.10_exNb4
chr6    41057316    41057449    +   ENSG00000001167.10_exNb5
chr6    41057941    41058048    +   ENSG00000001167.10_exNb6
chr6    41059265    41059433    +   ENSG00000001167.10_exNb7
chr6    41060649    41060824    +   ENSG00000001167.10_exNb8
chr6    41062133    41062236    +   ENSG00000001167.10_exNb9

Answer 1

awk -F\\t '$5 ~ /1$/ {next} {print}'

如果可能存在尾随空白，那么您可能希望使用/1 *$/作为正则表达式来强制执行上述操作。如果您的文件非常简单，那么您可以使用grep -v '1$'（或grep -v '1 *$'）等等。

当然，如果标准是基于所有尾随数字的数值，那么您必须进行调整。（在这种情况下，你必须考虑＆＃34; 01＆＃34;，＆＃34; 1E0＆＃34;，＆＃34; 1.0＆＃34;，＆＃34; 0.1e1＆＃34 ;等等。）

从包含特定数字的制表符分隔文本文件中删除行

1 个答案: