尝试将R dnorm()
中的pnorm()
和stats
函数导入Rcpp时,我遇到了以下奇怪的行为。
我将dnorm()
和pnorm()
的均值0和标准差1应用于观察向量。如果我在同一个向量上重复计算几次,有时我会得到不同的结果。看起来我在导入这两个函数时出错了,但这并不能解释为什么结果有时好,而其他不一致。
我在这里放置了从dnorm()
导入pnorm()
和stats
函数的函数:
{test_imp_script<-'
using Eigen::VectorXd;
VectorXd a = Rcpp::as<VectorXd>(aa);
Environment st("package:stats");
Function dn = st["dnorm"];
Function pn = st["pnorm"];
SEXP dd_a = dn(a,0,1);
SEXP pp_a = pn(a,0,1);
VectorXd d_a = as<VectorXd>(dd_a);
VectorXd p_a = as<VectorXd>(pp_a);
return List::create(Named("d") = d_a,Named("p") = p_a);'}
test_imp <- cxxfunction(signature( aa="numeric"), test_imp_script, plugin = "RcppEigen")
现在,尝试使用2000次重复的test_imp
运行以下示例。
set.seed(123)
t<-rnorm(1000,0,1)
a<-test_imp(t)
for (i in 1:2000){
set.seed(123)
b<-test_imp(t)
cat(i,"d",c(sum(b$d),sum(b$p)),"\n")
if (any(a$d!=b$d)) break
if (any(a$p!=b$p)) break
}
有时,实验在到达循环结束之前就会中断。有时却没有。没有明确的模式。
感谢您的回复。
答案 0 :(得分:9)
OMG这些已经可以使用。
首先,通过糖:
R> library(Rcpp)
R> cppFunction("NumericVector ex1() { return rnorm(5, 0, 1); }")
R> set.seed(42); ex1()
[1] 1.370958 -0.564698 0.363128 0.632863 0.404268
R>
其次,通过便利命名空间(但请注意,这不是矢量化的)
R> cppFunction("double ex2() { return R::rnorm(0, 1); }")
R> set.seed(42); ex2()
[1] 1.37096
R>
第三,如果你坚持,直接调用R API,这比之前的答案更少,但更丑陋:
R> cppFunction("double ex3() { return Rf_rnorm(0, 1); }")
R> set.seed(42); ex3()
[1] 1.37096
R>
我们不遗余力地提供免费和全面的文档。我真的不认为你看过它。这样做对你有利,因为不再依赖别人为你重新输入它。
(是的,您确实要求dnorm
和pnorm
但所有所谓的 d / p / q / r 功能统计分布是并行实现的。因此,在rnorm
存在的地方,您还有dnorm
,qnorm
和pnorm
,当然还有不同的参数。)