我有一个共生矩阵,我想将其转换为igraph对象。矩阵有三列 - node1
,node2
和freq
。
我使用graph_from_edgelist
命令创建了图表。
g <- graph_from_edgelist(as.matrix(coOccurDf[1:n,1:2]), directed=F)
我现在需要为边缘分配权重。我试图使用两个功能,这两个功能似乎都做同样的工作,但无济于事。
set.edge.attribute(g, "weight", index=E(g), coOccurDf[1:n,]$freq)
和
set_edge_attr(g, "weight", index=E(g), coOccurDf[1:n,]$freq)
这两个命令都不会引发错误,但是当我尝试使用
查看权重时E(g)$weight
它只显示NULL
。
任何帮助都将不胜感激。
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您可以按以下方式返回igraph
对象的权重:
edge.attributes(g)$weight
E(g)$weight
您可以通过分配以下任一对象来设置igraph
对象的权重:
edge.attributes(g)$weight <- coOccurDf[1:n,]$freq
E(g)$weight <- coOccurDf[1:n,]$freq
要使用set.edge.attribute
函数,它将返回分配了权重的新图形。要将其分配给对象g
而不是将加权图输出到控制台:
g <- set.edge.attribute(g, "weight", index=E(g), coOccurDf[1:n,]$freq)