我正在尝试安装" rpud"来自生物传导器的包装:
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("rpud")
这正常执行,但随后列出了几个旧的包依赖项,并询问我是否要更新它们:
Update all/some/none? [a/s/n]:
由于我将其提交给群集,因此无法回复此提示。有没有办法编写我的脚本,以便它响应" a"到这个提示?
此外,如果我回答" a"在上面的提示中,我收到了另一个提示:
Warning in install.packages(update[instlib == l, "Package"], l, contriburl = contriburl, :
'lib = "/opt/linux/centos/7.x/x86_64/pkgs/R/3.2.0/lib64/R/library"' is not writable
Would you like to use a personal library instead? (y/n)
我也想回复#34; y"对此。
谢谢!