Question

在阅读了大量的bash脚本线程和帮助网站后，我找不到有效的解决方案。

我想将一个变量参数'i'从脚本传递到另一个脚本$ i，然后将其发送到程序“$ 1”。在程序中，我从参数向量（** argv）中读取变量，然后使用此变量将输出文件的名称修改为* _0，* _1，* _2，...，* _n。

我的想法是，我可以为程序的每个实例提供唯一的输出文件。该程序是并行的，但由于计算资源的限制，我需要为最多四个计算节点提交一个作业 - 或者它永远不会通过该计算节点。所以，我想剥离64个4节点作业。

到目前为止，我已阅读过主题：

“ - C选项”Passing arguments to /bin/bash via a bash script
“传递参数” http://linux.about.com/od/Bash_Scripting_Solutions/a/How-To-Pass-Arguments-To-A-Bash-Script.htm
“以参数$ 0或＃1开头” How can I pass a file argument to my bash script using a Terminal command in Linux?
“传递参数” http://how-to.wikia.com/wiki/How_to_read_command_line_arguments_in_a_bash_script
我问的问题完全相同，但答案对我的案例Using a loop variable in a bash script to pass different command-line args

阅读完这些内容之后，我对这个概念感到满意，但仍然令人困惑的是如何使用-C和-S命令，或者它们是否被使用;大多数例子都不包括这些。

这是我的衍生预备剧本

#
#$ -cwd
#$ -S /bin/bash
#$ -pe fah 1
for((i=0; i < 2; i++)); do qsub test_S17_script.sh $i; done

旁边信息：what is qsub

这是我的剧本

#
#$ -M duser@acme_u.edu
#$ -m bae
#$ -cwd
#$ -S /bin/bash
#$ -pe fah 1

./daedalus_linux_1.3_64 1 "$1"

因此，衍生工作正常，并生成文件。并且，脚本可以正常传递常量./daedalus_linux_1.3_64 1 1，但传递变量不起作用。我不知道处方是否正确地将变量i传递给脚本。我不知道如何从脚本写入错误文件 - 或者如果这是我想检查变量是否通过的方式。计算没有用户界面，所以一旦它在队列中，我必须依赖于错误文件输出。

提前感谢您的帮助。

Answer 1

如果您希望将脚本中的标准输出传递给脚本，你可以这样做：

./daedalus_linux_1.3_64 1 `<prescript>`

如果前言打印出for循环（i = 0，i = 1）的每次迭代输出在不同的行上，你可能会将你的脚本生成的输出传递给xargs命令。

在规定中，您可以更改输出格式，以在一行中显示每次qsub迭代生成的所有输出，如下所示：

for((i=0; i < 2; i++)); do qsub test_S17_script.sh $i; done | xargs

或者您可以按如下方式使用xargs：

./daedalus_linux_1.3_64 1 `<prescript> | xargs`

希望有所帮助。

Answer 2

考虑使用PBS Job Arrays。单个pbs脚本将提交多个作业，每个作业将具有不同的环境变量$ PBS_ARRAY_INDEX。

将变量脚本参数传递给另一个脚本，然后将qsub传递给程序

2 个答案: