我正在为我的数据计算SVD。但每当我使用spark-submit
提交Spark应用程序时,日志文件都会声明:
WARN ARPACK/BLAS: Failed to load implementation from: com.github.fommil.netlib.NativeSystemARPACK/BLAS
我使用-Pnetlib-lgpl
标志构建Spark,并在创建jar文件时在我的sbt文件中包含netlib依赖项:
libraryDependencies ++= Seq(
"org.apache.spark" % "spark-core_2.10" % "1.5.0" % "provided",
"org.apache.spark" % "spark-mllib_2.10" % "1.3.0",
"com.github.fommil.netlib" % "all" % "1.1.2" pomOnly()
)
GCC和Gfortran版本为gcc version 4.8.0 (GCC)
。我还安装了BLAS,LAPACK和ATLAS,并按照netlib网站上的说明进行操作:https://github.com/fommil/netlib-java
导入为spark-shell
时,import com.github.fommil.netlib._
中没有任何迹象表明它未导入。
我已经尝试了一段时间来调试这个问题而且我没有想法。有人帮我解决这个问题。
答案 0 :(得分:3)
这是一个众所周知的痛点。
我已成功按照指令@ https://github.com/PasaLab/marlin/issues/1使用英特尔MKL在Spark 1.4.x / 1.5.x中使用这个可怕的东西
我认为大概有一个地方你必须调整这些指令以与ATALAS联系,但它应该是可行的。