获取箱线图的数据 - 熊猫

时间:2015-11-04 09:45:30

标签: python pandas

我需要获取生成的统计数据,以便在Pandas中绘制一个箱形图(使用数据框创建箱形图)。即Quartile1,Quartile2,Quartile3,较低的晶须值,较高的晶须值和异常值。 我尝试了以下查询来绘制boxplot。

import pandas as pd
df = pd.DataFrame(np.random.rand(100, 5), columns=['A', 'B', 'C', 'D', 'E'])
pd.DataFrame.boxplot(df,return_type = 'both')

有没有办法做到而不是手动计算值?

2 个答案:

答案 0 :(得分:9)

一种选择是使用图中的y数据 - 可能对离群值(传单)最有用

_, bp = pd.DataFrame.boxplot(df, return_type='both')

outliers = [flier.get_ydata() for flier in bp["fliers"]]
boxes = [box.get_ydata() for box in bp["boxes"]]
medians = [median.get_ydata() for median in bp["medians"]]
whiskers = [whiskers.get_ydata() for whiskers in bp["whiskers"]]

但使用

获取其他值(包括IQR)可能更为直接
quantiles = df.quantile([0.01, 0.25, 0.5, 0.75, 0.99])

或者,正如WoodChopper所建议的

stats = df.describe()

答案 1 :(得分:1)

  • 要获取箱线图数据,请使用matplotlib.cbook.boxplot_stats,它会返回用于使用matplotlib.axes.Axes.bxp绘制一系列箱线图和晶须图的统计词典列表。
    • 要获取箱线图统计信息,请将array传递到boxplot_stats
      • 这不专门针对pandas
  • pandas的默认绘图引擎为matplotlib,因此使用boxplot_stats将返回pandas.DataFrame.plot.box的正确度量。
  • 使用df.values,将感兴趣的数字列boxplot_stats一起传递给array
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
form matplotlib.cbook import boxplot_stats
import numpy as np

# test dataframe
np.random.seed(346)
df = pd.DataFrame(np.random.rand(100, 5), columns=['A', 'B', 'C', 'D', 'E'])

# plot the dataframe as needed
ax = df.plot.box(figsize=(8, 6), showmeans=True)
ax.grid()

enter image description here

  • 通过将array传递到boxplot_metrics来提取箱线图度量
    • df.valuesnumpy.ndarray
  • dictsdf中的列数组的顺序相同。
  • 此数据没有异常值fliers,因为它是由numpy.random生成的。
# get stats
stats = boxplot_stats(df.values)

print(stats)
[out]:
[{'cihi': 0.6008396701195271,
  'cilo': 0.45316512285356997,
  'fliers': array([], dtype=float64),
  'iqr': 0.47030110594253877,
  'mean': 0.49412631128104645,
  'med': 0.5270023964865486,
  'q1': 0.2603486498337239,
  'q3': 0.7306497557762627,
  'whishi': 0.9941975539538199,
  'whislo': 0.00892072823759571},
 {'cihi': 0.5460977498205477,
  'cilo': 0.39283808760835964,
  'fliers': array([], dtype=float64),
  'iqr': 0.4880880962171596,
  'mean': 0.47578540593013985,
  'med': 0.4694679187144537,
  'q1': 0.2466015651284032,
  'q3': 0.7346896613455628,
  'whishi': 0.9906905357196321,
  'whislo': 0.002613905425137064},
 {'cihi': 0.6327876179340386,
  'cilo': 0.47317829117336885,
  'fliers': array([], dtype=float64),
  'iqr': 0.5083099578365278,
  'mean': 0.5202481643792808,
  'med': 0.5529829545537037,
  'q1': 0.24608370844800756,
  'q3': 0.7543936662845353,
  'whishi': 0.9968264819096214,
  'whislo': 0.008450848029956215},
 {'cihi': 0.5429786764060252,
  'cilo': 0.40089287519667627,
  'fliers': array([], dtype=float64),
  'iqr': 0.4525025516221303,
  'mean': 0.4948030963370377,
  'med': 0.4719357758013507,
  'q1': 0.279181107815125,
  'q3': 0.7316836594372553,
  'whishi': 0.9836196084903415,
  'whislo': 0.019864664399723786},
 {'cihi': 0.5413819754851169,
  'cilo': 0.3838462046931251,
  'fliers': array([], dtype=float64),
  'iqr': 0.5017062764076173,
  'mean': 0.4922357500877824,
  'med': 0.462614090089121,
  'q1': 0.2490034171367362,
  'q3': 0.7507096935443536,
  'whishi': 0.9984043081918205,
  'whislo': 0.0036707224412856343}]