我创建了一个对称矩阵,这是输入到R中的sem()函数所必需的,但是不断得到一个错误,表明矩阵不对称。
当我逐个元素检查时,我发现没有差异。
isSymmetric()检查是否具有更高的精度?如果是这样,我怎样才能强制矩阵在内存中对称?
SCA = c(1,.73,.70,.58,.46,.56)
PPE = c(.73,1,.68,.61,.43,.52)
PTE = c(.7,.68,1,.57,.4,.48)
PFE = c(.58,.61,.57,1,.37,.41)
EA = c(.46,.43,.4,.37,1,.72)
CP = c(.56,.52,.48,.41,.71,1)
ability = as.matrix(cbind(SCA,PPE,PTE,PFE,EA,CP))
rownames(ability)=t(colnames(ability))
ability.diag = diag(ability)
ability[lower.tri(ability,diag=T)] = 0
ability = ability + t(ability) + diag(ability.diag)
ability
# SCA PPE PTE PFE EA CP
# SCA 1.00 0.73 0.70 0.58 0.46 0.56
# PPE 0.73 1.00 0.68 0.61 0.43 0.52
# PTE 0.70 0.68 1.00 0.57 0.40 0.48
# PFE 0.58 0.61 0.57 1.00 0.37 0.41
# EA 0.46 0.43 0.40 0.37 1.00 0.71
# CP 0.56 0.52 0.48 0.41 0.71 1.00
sum(ability != t(ability))
# [1] 0
isSymmetric(ability)
# [1] FALSE
答案 0 :(得分:2)
使用函数isSymmetric
实现函数all.equal
。正在测试的不是矩阵是否等于其转置,逐个元素,而是这两个矩阵是否等于R
个对象。在你的情况下,他们不是:如果你看看他们的结构,你会得到以下结果:
> str(ability)
num [1:6, 1:6] 1 0.73 0.7 0.58 0.46 0.56 0.73 1 0.68 0.61 ...
- attr(*, "dimnames")=List of 2
..$ : chr [1, 1:6] "SCA" "PPE" "PTE" "PFE" ...
..$ : chr [1:6] "SCA" "PPE" "PTE" "PFE" ...
> str(t(ability))
num [1:6, 1:6] 1 0.73 0.7 0.58 0.46 0.56 0.73 1 0.68 0.61 ...
- attr(*, "dimnames")=List of 2
..$ : chr [1:6] "SCA" "PPE" "PTE" "PFE" ...
..$ : chr [1, 1:6] "SCA" "PPE" "PTE" "PFE" ...
所以问题在于如何生成ability
的行名。您可以轻松解决此问题:
> rownames(ability) <- colnames(ability)
> isSymmetric(ability)
[1] TRUE