在Linux中将.csv转换为.bed

Question

我想使用“awk”命令将.csv格式的文件转换为.bed。 但我不知道如何为此命令定义空间.. 你能指导我吗？

Answer 1

您可以使用tr翻译字符。我查了.bed文件，看起来它们只是以制表符分隔。

echo "1,2,3" | tr ',' '\t'

打印1 2 3，因此运行cat file1.csv | tr ',' '\t' > file2.bed会得到制表符分隔的文件。