我有两个数据框,一个有两个(或更多)个体(用sampleID
表示),由TEST
表示,另一个只有3个列,名为REF
。
我想根据REF
的{{1}}列与TEST
的相应(按顺序)列之间的重叠,将"chr","start","end"
添加到REF
上:TEST
。
我希望重叠的定义是为了使"Chromosome","Start","End"
间隔与REF
间隔重叠,它必须覆盖TEST
间隔的> 50%。
我一直在玩GenomicRanges。但是,TEST
函数只允许我将findOverlap
指定为重叠位置的数量,而不是所覆盖间隔的一小部分。那么,使用GenomicRanges,我该怎么做?
一些示例输入:
minOverlap