Question

除了我之前的问题R: How to match/join 2 matrices of different dimensions (nrow/ncol)?，我需要一个循环，因为我有一个超过1000个矩阵的列表。我决定使用代码（来自答案）

full_matrix[rownames(full_matrix) %in% rownames(small_matrix), 
            colnames(full_matrix) %in% colnames(small_matrix)] <- small_matrix

在我的情况下，单个矩阵匹配工作正常。但是，我在将此代码实现到list matrices“small_matrix”的循环中时遇到问题。这是我的代码：

full_matrix <- list()
for(i in 1:length(small_matrix)) 
{
  full_matrix[i][rownames(full_matrix[i]) %in% rownames(small_matrix[i]), 
                 colnames(full_matrix[i]) %in% colnames(small_matrix[i])] <- small_matrix[i]
}

我收到错误：incorrect number of subscripts on matrix，这可能是由于我对循环的基本知识中的错误索引造成的。我感谢任何帮助。感谢

根据@Jim M的答案进行新编辑： 你的答案适用于这个例子，但是应该像在前一个question中一样在循环中创建small_matrix（ces）。在这里您可以找到代码示例：

library(abind)

a = c("A", "B", "C", "D", "E", "F")
full_matrix = array(dim=c(6,6,2))
dimnames(full_matrix) <- list(levels(as.factor(a)), levels(as.factor(a)), 
                              c("mat1","mat2"))

正如@Jim M.建议的那样。这里有新代码：

##### new part for small matrix
df_import <- data.frame(OC = c("A", "A", "B", "B", "C", "C", "D", "D"),
                        TC = c("Z", "Z", "Y", "Y", "X", "X", "W", "W"),
                        Value = c(1,2,3,4,5,6,7,8),
                        Year = c(2010,2011))
Import_Year <- split(df_import, df_import$Year)

library(reshape2)
small_matrix <- list()
for(i in 1:length(unique(Import_Year))) 
{
  small_matrix[[length(small_matrix)+1]] <- dcast(OC ~ TC, data =Import_Year[[i]], value.var = "Value")
}
small_matrix
##### end new part

并且比@Jim的for循环更进一步。 L：

for(i in seq_along(small_matrix_list)){
  afill(full_matrix[, , i], local= TRUE ) <- small_matrix[[i]]   
}

但是，我收到以下错误消息：

Error in `afill<-.default`(`*tmp*`, local = TRUE, value = list(OC = 1:4,  : 
  'x' must have names on dimensions corresponding to those in 'value'

有什么想法吗？感谢

Answer 1

我会将你的完整“矩阵”创建为一个三维数组而不是一个列表，然后通过循环遍历数组三维维度的相应索引，用一个较小矩阵列表填充这个数组。

library(abind)

a = c("A", "B", "C", "D", "E", "F")
full_matrix = array(dim=c(6,6,2))
dimnames(full_matrix) <- list(levels(as.factor(a)), levels(as.factor(a)), 
    c("mat1","mat2"))

small_matrix_1 = matrix(c(2, 4, 3, 1, 5, 7, 3, 1, 6), nrow=3, ncol=3)
dimnames(small_matrix_1) <- list(c("B","C","E"), c("A","B","F"))

small_matrix_2 = matrix(c(20, 40, 30, 10, 50, 70, 30, 10, 60), nrow=3, ncol=3)
dimnames(small_matrix_2) <- list(c("B","C","E"), c("A","B","F"))

small_matrix_list <- list(small_matrix_1, small_matrix_2)

for(i in seq_along(small_matrix_list)){
    afill(full_matrix[, , i], local= TRUE ) <- small_matrix_list[[i]]   
}

给予 full_matrix 第三个索引对应于每个小矩阵。

, , mat1

   A  B  C  D  E  F
A NA NA NA NA NA NA
B  2  1 NA NA NA  3
C  4  5 NA NA NA  1
D NA NA NA NA NA NA
E  3  7 NA NA NA  6
F NA NA NA NA NA NA

    , , mat2

   A  B  C  D  E  F
A NA NA NA NA NA NA
B 20 10 NA NA NA 30
C 40 50 NA NA NA 10
D NA NA NA NA NA NA
E 30 70 NA NA NA 60
F NA NA NA NA NA NA

修改：不像上一个问题那样使用dcast创建data.frames，而是将数据转换为数组（acast），以便将它们插入到更大的阵列。

library(reshape2) 
small_matrix <- vector(mode = "list", length = 2) # Pre-allocate space in the list

for (i in seq(Import_Year)){
  small_matrix[[i]] <- acast(OC ~ TC, data = Import_Year[[i]], value.var = "Value")
}

Answer 2

我发现了几个问题：

使用[[选择列表中的元素，例如small_matrix[[i]]。
full_matrix初始化为空列表。因此full_matrix[i]评估为list(NULL)
您的初始代码假定small_matrix的所有行和列名都出现在full_matrix中。如果他们这样做，您可以简化分配如下（*）。（如果不能保证，您需要通过名称的交集对两边进行子集化。）
确保full_matrix正确初始化。您可能还有一个矩阵列表，或者一个常用的完整矩阵，您可以在其中替换不同的子块。

（*）

full_matrix[rownames(small_matrix), colnames(small_matrix)] <- small_matrix

R：如何在LOOP中匹配/连接不同维度（nrow / ncol）的2个矩阵？

2 个答案: