我遇到了一个可能很简单的问题 - 如何对连续的重复行进行求和并删除除第一行之外的所有行。并且,如果两个重复项之间存在NA
(例如2,na,2
),请将它们相加并删除除第一个条目之外的所有条目。
到目前为止一切顺利,这是我的样本数据
ia<-c(1,1,2,NA,2,1,1,1,1,2,1,2)
time<-c(4.5,2.4,3.6,1.5,1.2,4.9,6.4,4.4, 4.7, 7.3,2.3, 4.3)
a<-as.data.frame(cbind(ia, time))
示例输出
a
ia time
1 1 4.5
2 1 2.4
3 2 3.6
4 NA 1.5
5 2 1.2
6 1 4.9
7 1 6.4
8 1 4.4
9 1 4.7
10 2 7.3
11 1 2.3
12 2 4.3
现在我想
1.)总结&#34;时间&#34;连续ia的列 - 即,如果数字1在彼此之后两次或更多次出现的时间总和,在我的情况下,将第一和第二列的列时间加到4.5+2.4
。
2。)如果两个数字(ia列)之间存在NA
个(i.e., ia = 2, NA, 2)
,那么也将所有这些时间相加。
3。)仅保留ia
的第一次出现,并删除其余部分。
最后,我希望得到类似的东西:
a
ia time
1 1 6.9
3 2 6.3
6 1 20.4
10 2 7.3
11 1 2.3
12 2 4.3
我发现这是为了求和,但它没有考虑连续因子
aggregate(time~ia,data=a,FUN=sum)
我发现这是为了删除
a[cumsum(rle(as.numeric(a[,1]))$lengths),]
尽管rle方法保留了最后一个条目,但我希望保留第一个条目。我也不知道如何处理NAs
。
如果我的模式为1-NA-2
,那么NA
不应计入其中任何一个,在这种情况下,应删除NA
行。
答案 0 :(得分:5)
使用data.table
(正如RHertel为na.locf
建议的那样):
library(data.table)
library(zoo)
setDT(a)[na.locf(ia, fromLast=T)==na.locf(ia), sum(time), cumsum(c(T,!!diff(na.locf(ia))))]
# id V1
#1: 1 6.9
#2: 2 6.3
#3: 3 20.4
#4: 4 7.3
#5: 5 2.3
#6: 6 4.3
答案 1 :(得分:3)
首先需要用它们周围的值替换NAs序列(如果它们是相同的)。 This answer显示了动物园的na.locf
函数,该函数用最后一个观察值填充了NA。通过测试向后或向前移动值是否相同,您可以过滤掉您不想要的NA,然后继续前进:
library(dplyr)
library(zoo)
a %>%
filter(na.locf(ia) == na.locf(ia, fromLast = TRUE)) %>%
mutate(ia = na.locf(ia))
#> ia time
#> 1 1 4.5
#> 2 1 2.4
#> 3 2 3.6
#> 4 2 1.5
#> 5 2 1.2
#> 6 1 4.9
#> 7 1 6.4
#> 8 1 4.4
#> 9 2 7.3
#> 10 1 2.3
#> 11 2 4.3
现在您已经修复了这些NA,您可以使用cumsum
对连续的值集进行分组。完整的解决方案是:
result <- a %>%
filter(na.locf(ia) == na.locf(ia, fromLast = TRUE)) %>%
mutate(ia = na.locf(ia)) %>%
mutate(change = ia != lag(ia, default = FALSE)) %>%
group_by(group = cumsum(change), ia) %>%
summarise(time = sum(time))
result
#> Source: local data frame [6 x 3]
#> Groups: group [?]
#>
#> group ia time
#> (int) (dbl) (dbl)
#> 1 1 1 6.9
#> 2 2 2 6.3
#> 3 3 1 15.7
#> 4 4 2 7.3
#> 5 5 1 2.3
#> 6 6 2 4.3
如果您要删除group
列,请使用其他行:
result %>%
ungroup() %>%
select(-group)
答案 2 :(得分:2)
nas <- which(is.na(df$ia))
add.index <- sapply(nas, function(x) {logi <- which(as.logical(df$ia))
aft <- logi[logi > x][1]
fore <- tail(logi[logi< x], 1)
if(df$ia[aft] == df$ia[fore]) aft else NA})
df$ia[nas] <- df$ia[add.index]
df <- df[complete.cases(df),]
首先,我们确定列的NA值是否被相同的值包围。如果是,则周围值替换NA。如果数据具有连续的NA值,则没有问题。
接下来,我们按组操作进行标准求和。 cumsum
允许我们根据数字的变化创建一个唯一的组。
df$grps <- cumsum(c(F, !df$ia[-length(df$ia)] == df$ia[-1]))+1
aggregate(time ~ grps, df, sum)
# grps time
# 1 1 6.9
# 2 2 6.3
# 3 3 20.4
# 4 4 7.3
# 5 5 2.3
# 6 6 4.3
这是base R
方法。使用dplyr
,zoo
或data.table
等软件包可以使用不同的选项,因为它们构建了专门的功能来完成我们在此处所做的工作。