Question

我正在尝试编译，安装和运行我们称之为myPackage的包。它包含一个*.pyx文件，可以从库fftw_set_timelimit()调用函数fftw。目前，当我运行导入包的脚本clientScript.py时，我收到以下错误消息：

Traceback (most recent call last):
  File "clientScript.py", line 5, in <module>
    import myPackage.myModule
ImportError: /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/myPackage/myModule.so: undefined symbol: fftw_set_timelimit

根据我的理解（我是python和cython的新手），我的包中尚未执行与C库的链接。实际上，我的setup.py文件看起来像这样：

from setuptools   import setup,find_packages
from Cython.Build import cythonize
import os

setup(
    name = "myPackage",
    version = "0.0.1",
    url = "none",
    author = "me",
    author_email = "me@me.me",
    packages=find_packages(),
    ext_modules = cythonize("pyClo/pyClo.pyx"),
)

您可以看到我的setup.py文件使用setuptools。我决定这样做，因为Python Packaging User Guide推荐。但是，Cython documentation中的说明改为使用distutils。链接库是通过调用distutils.Extension('file',['file.pyx'],libraries='fftw')完成的。如何使用setuptools获得相同的结果？

Answer 1

结果setuptools有一个模块setuptools.extension.Extension，其使用方式与distutils.extension.Extension模块相同。

最后，setup.py文件看起来像：

from setuptools import setup, find_packages
from setuptools.extension import Extension
from Cython.Build import cythonize

extensions = [
    Extension(
        "myPackage.myModule",
        ["myPackage/myModule.pyx"],
        include_dirs=['/some/path/to/include/'], # not needed for fftw unless it is installed in an unusual place
        libraries=['fftw3', 'fftw3f', 'fftw3l', 'fftw3_threads', 'fftw3f_threads', 'fftw3l_threads'],
        library_dirs=['/some/path/to/include/'], # not needed for fftw unless it is installed in an unusual place
    ),
]

setup(
    name = "myPackage",
    packages = find_packages(),
    ext_modules = cythonize(extensions)
)

以下是我的安装目录概述：

.
├── MANIFEST.in
├── myPackage
│   └── myModule.pyx
├── README.rst
└── setup.py

其中myModule.pyx是调用fftw_set_timelimit()的文件。

MANIFEST.in包含：

include myPackage/*.*

和README.rst仅仅是纯文本文件。

使用setuptools创建一个调用外部C库的cython包

1 个答案: