我试图在automap包中使用autoKrige()函数来简单地应用泛型克里金法。我有一个不规则间隔的测量网格,我想在它们之间以精细的空间尺度进行插值。示例代码:
library('automap')
# create an irregularly spaced grid
y <-x <-c(-5,-4,-2,-1,-0.5,0,0.5,1,2,4,5)
grid <-expand.grid(x,y)
names(grid) <-c('x', 'y')
# create some measurements, greatest in the centre, with some noise
vals <-apply(grid,1, function(x) {12/(0.1+sqrt(x[1]^2 + x[2]^2))+rnorm(1,2,1.5)})
# get data into sp format
s <-SpatialPointsDataFrame(grid, data.frame(vals))
# make some prediction locations and get them into sp format
pred <-expand.grid(seq(-5,5,by=0.5), seq(-5,5,by=0.5))
pred <-cbind(pred[,1], pred[,2]) # this seems to be needed, not sure why
pred <-SpatialPoints(pred)
# try universal kriging
surf <-autoKrige(vals~x+y, s, new_data=pred)
这会导致错误:
Error in gstat.formula.predict(d$formula, newdata, na.action = na.action, :
NROW(locs) != NROW(X): this should not occur
我试过让new_data与原始数据具有相同的行数,甚至尝试使new_data中的坐标与原始数据完全相同,但我仍然遇到此错误。我是地质统计学技术的新手,如果我犯了一个基本错误,请道歉。任何人都可以告诉我哪里出错了?感谢。
答案 0 :(得分:3)
问题是你有autoKrige
函数的语法错误。输入到autoKrige
的公式指定了您要使用的线性模型,例如:
log(zinc) ~ dist
来自meuse
数据集的。在这种情况下,您使用线性模型对log(zinc)
与dist
进行建模,并使用变差函数对此模型的残差进行插值。从本质上讲,普遍克里金法是具有空间相关残差的线性回归。
在您的情况下,您指定:
val ~ x+y
所以autoKrige(实际上gstat
)会尝试首先对vals
与x
和y
的线性模型进行建模(多元回归),并使用以下内容对残差进行插值变差函数模型。但是,x
中不存在y
和SpatialPointsDataFrame
变量。
我认为您想要做的是仅使用变差函数模型进行空间插值。在这种情况下,线性模型非常简单,实际上只是拟合平均值:
vals ~ 1
其中确定vals
的平均值,并使用变差函数模型对残差进行插值。这实际上被称为普通克里金法。您拨打autoKrige
的电话会是:
surf <-autoKrige(vals ~ 1, s, new_data=pred)