在Python中有效地保存表

时间:2015-09-04 21:37:28

标签: python pandas

我的原始数据是纯文本文件。它由1255行和43列组成。我想创建一个只有我感兴趣的数据的文本文件,而不是处理所有数据。

例如,假设我想选择验证条件的所有数据:1 < column 26 < 7。这是我的代码:

import numpy as np
import csv
import os

data = np.genfromtxt('data.txt', dtype = None)

path = os.getcwd()

csvfile = path + '/subgp1.txt'

counter = 0
with open(csvfile, 'w') as output:
    writer = csv.writer(output, delimiter = '\t')

    for row in range(len(data)):
        if (data[row][26] > 1 and data[row][26] < 7):
            counter += 1
            writer.writerow([counter, data[row][1], data[row][2], data[row][3], ... data[row][42]])

代码中的最后一行是我只是将数据重新写入我创建的subgp1.txt。是否有更有效的方法来做同样的事情?

我的理由是:

1。最后一行应该简化。就我而言,最后一行看起来像这样:

writer.writerow([counter, '%-8d' % data[row][1], data[row][2], 
                     data[row][3], '%-2.6f' % data[row][4], '%-2.6f' % data[row][5], 
                     '%-2.6f' % data[row][6], '%-2.2f' % data[row][7], 
                     '%-2.2f' % data[row][8], '%-2.2f' % data[row][9], ..., '%-2.4f' % data[row][42]])

2。我有42列,所以这是浪费时间。我相信有更简洁,更快捷的方法。

pandas在与我寻求的任务类似的任务中是否更有效?

2 个答案:

答案 0 :(得分:0)

而不是写作:

writer.writerow([counter, data[row][1], data[row][2], data[row][3], ... data[row][42]])

您可以将[counter]data[row]切片连接起来:

writer.writerow([counter] + data[row][1:])

更好的是,您可以直接迭代数据行:

for row in data:
    if (row[26] > 1 and row[26] < 7):
        counter += 1
        writer.writerow([counter] + row[1:])

答案 1 :(得分:0)

您需要为此导入集合,但之后您可以执行此操作:

for ctr,row in enumerate(collections.ifilter(lambda r:r[26]>1 and r[26]<7, data)):
    writer.writerow([ctr, "%-8d' % row[1], row[2], row[3], 
                     '%-2.6f' %row[4],...])

问题是你认为效率低下的是什么?一次指定每个字段的格式?

如果您提前了解格式,可以使用它。

format_strings = ('%d', '%-8d', '%s', '%s', '%-2.6f', ...)
for ctr,row in enumerate(collections.ifilter(lambda r:r[26]>1 and r[26]<7, data)):
    writer.writerow([f%v for f,v in zip(format_strings, [ctr]+row)])