Question

我正在尝试使用MATLAB从文本文件中提取轮廓点。包含这些轮廓点的线的示例是：

Cnt-0-Pt        0/0/146/171/5/146.912065/171.618881/5.500000/0

请注意，并非每一行都以字符串Cnt-0-Pt开头（因为这些文件中除了轮廓点之外还有其他字段），但每个轮廓点线的字段字符串总是有0，也就是说，例如，不是轮廓点线将以Cnt-1-Pt开始的选项。在该字符串之后，有一个空格和两个选项卡。我想提取第二个/分隔符后面的三个整数。在这个例子中，它们将是146,171和5.这样做最直接的方法是什么？

以下是文本文件的示例

的示例

#
# Direction U 
#
U-Number        92
U-Scale         1.470000
#
# Direction V 
#
V-Number        204
V-Scale         1.470000
#
# Direction W 
#
W-Number        16
W-Scale         1.470000
s-base-plane        0
#
#  Video/Recorder Parameters
#
play-mode        toggle
rotate-mode         ObjAxis
d-xrotate       0.000
d-yrotate       0.000
d-zrotate       0.000
#
#  Cut-Oblique Parameters
#
Plane-size      1.470
Plane-2D        off
Plane-3D        off
#
#  ValidVol Parameters
#
validity-field      ignored
#
#  Histogram Parameters
#
histo-scale         1.000000
#
#  VOI Parameters
#
Margin-Mode         2
#
#  VOI Segmentations
#
Slice-Dist-U        0.562500
Slice-Dist-V        0.562500
Slice-Dist-W        3.000000
MVol_Volume         0
#Contour 0 Parameter 
Contour-Start    0
Cnt-0-Contour-name      Prostate
Cnt-0-Contour-color-list        16711680
Cnt-0-Contour-color         16711680
Cnt-0-Contour-Type      0
Cnt-0-Contour-Class         0
Cnt-0-Contour-Mandatory         1
Cnt-0-Contour-num       19
Cnt-0-Inter-Contour-color       12517376
Cnt-0-Segmentation_U        No
Cnt-0-Segmentation_V        No
Cnt-0-Segmentation_W        Yes
Cnt-0-Cnt       919.658969/118.184765/919.658969/118.184765/5
Cnt-0-Pt        0/0/146/171/5/146.912065/171.618881/5.500000/0
Cnt-0-Pt        0/0/148/154/5/148.514670/154.791536/5.500000/0
Cnt-0-Pt        0/0/153/146/5/153.055382/146.511414/5.500000/0
Cnt-0-Pt        0/0/165/139/5/165.876216/139.299695/5.500000/0
Cnt-0-Pt        0/0/178/140/5/178.429949/140.635199/5.500000/0
Cnt-0-Pt        0/0/188/143/5/188.045574/143.306206/5.500000/0
Cnt-0-Pt        0/0/195/152/5/195.524394/152.921831/5.500000/0
Cnt-0-Pt        0/0/203/164/5/203.804516/164.140061/5.500000/0
Cnt-0-Pt        0/0/206/178/5/206.475523/178.563499/5.500000/0
Cnt-0-Pt        0/0/206/191/5/206.475523/191.384333/5.500000/0
Cnt-0-Pt        0/0/204/201/5/204.338717/201.267059/5.500000/0
Cnt-0-Pt        0/0/199/208/5/199.530904/208.745879/5.500000/0
Cnt-0-Pt        0/0/193/213/5/193.387588/213.553691/5.500000/0
Cnt-0-Pt        0/0/186/213/5/186.175869/213.820792/5.500000/0
Cnt-0-Pt        0/0/180/206/5/180.833855/206.876174/5.500000/0
Cnt-0-Pt        0/0/176/198/5/176.026042/198.061851/5.500000/0
Cnt-0-Pt        0/0/169/189/5/169.348525/189.514628/5.500000/0
Cnt-0-Pt        0/0/162/182/5/162.671007/182.570010/5.500000/0
Cnt-0-Pt        0/0/152/177/5/152.254080/177.495096/5.500000/0
Cnt-0-Cnt       1210.414404/141.990846/1210.414404/141.990846/6
Cnt-0-Pt        0/0/173/139/6/173.622136/139.833897/6.500000/0
Cnt-0-Pt        0/0/181/131/6/181.368056/131.286674/6.500000/0
Cnt-0-Pt        0/0/197/129/6/197.126998/129.951171/6.500000/0
Cnt-0-Pt        0/0/207/142/6/207.009724/142.772005/6.500000/0
Cnt-0-Pt        0/0/214/153/6/214.221443/153.990234/6.500000/0

Answer 1

问题在于，您实际上有一个非平凡的可变行标题，并且不同的元素与您感兴趣的数据混合在一起。通常，这样的文件需要逐行解析（文件格式应该使用XML结构），但也可以使用快速textscan。

第一步是在文件中找到'Cnt-0-Pt'行开始的点。下面的代码使用fgetl一次获得一行，直到找到'Cnt-0-Cnt'行。然后textscan用于读取文件的其余部分并将相关的三列保存到单元格数组中。

fid = fopen('test.txt');
while ~strncmp(fgetl(fid),'Cnt-0-Cnt',9)
end
C = textscan(fid,'%*s%*f/%*f/%f/%f/%f/%*s','CommentStyle','Cnt-0-Cnt')
fclose(fid);

textscan格式字符串'%*s%*f/%*f/%f/%f/%f/%*s'忽略第一个字符串，前两个数字以及您感兴趣的三个数字后的所有内容。'CommentStyle'用作排序拒绝任何以'Cnt-0-Cnt'开头的后续行的技巧。有关更多详细信息，请参阅textscan文档。通过将所有字段名称添加到while单元格数组，例如'CommentStyle'，可以避免{'#','U-Number','U-Scale','V-Number',...}循环。

Answer 2

@ horchler答案的一个不那么聪明，稍微更明确的版本：

fID = fopen('test.txt', 'r');

ii = 1;
mydata = [];
while ~feof(fID) % Loop until we've reached the end of the file
    tline = fgetl(fID);
    if ~isempty(regexp(tline, 'Cnt-0-Pt', 'Once'))
        % Matched the line we want, parse it
        splitline = regexp(tline, '/', 'split'); % Split along the / delimiter
        tdata = cellfun(@str2double, splitline(3:5), 'UniformOutput', false); % Convert the strings you want to doubles
        mydata(ii,:) = [tdata{:}]; % Pull data out of the cell array
        ii = ii + 1;
    end
end

fclose(fID);

这会逐行浏览您的文件，直到它结束。如果找到您的Cnt-0-Pt字符串，它会解析您的数据行，否则该行将被丢弃。

这可能是一种非常计算密集的方法，因为它不能发挥MATLAB的任何优势。由于数据的大小和布局是可变的，因此无法预先分配或告诉MATLAB在文件中的具体位置。虽然在这种情况下，逐行方法可能是唯一的好选择。

在MATLAB中解析文件的最简单方法

2 个答案: