如何在不覆盖的情况下编写hdf5文件?

时间:2015-08-09 07:23:55

标签: python h5py

很抱歉,这是h5py上的一个非常基本的问题。

我正在阅读文档,但我没有找到类似的例子。

我试图用Python创建多个hdf5数据集,但是在我关闭文件数据后会被覆盖。

我们说我做了以下事情:

import numpy as np
import h5py
f = h5py.File('test.hdf5', 'w')
f.create_dataset('data1', data = np.ones(10))
f.close()
f = h5py.File('test.hdf5', 'w')
f.create_dataset('data0', data = np.zeros(10))
f.close()
f = h5py.File('test.hdf5', 'r')
f["data1"].value
f.close()

我得到了

  

KeyError:"无法打开对象(对象' data1'不存在)"

如果我追加数据,则需要先在'w'模式下打开,然后在'a'模式下追加,有两个不同的语句。

import numpy as np
import h5py
f = h5py.File('test.hdf5', 'w')
f.create_dataset('data1', data = np.ones(10))
f.close()
f = h5py.File('test.hdf5', 'a')
f.create_dataset('data0', data = np.zeros(10))
f.close()
f = h5py.File('test.hdf5', 'r')
f["data1"].value
f.close()

如果我在'a'模式下打开文件:

import numpy as np
import h5py
f = h5py.File('test.hdf5', 'a')
f.create_dataset('data1', data = np.ones(10))
f.close()
f = h5py.File('test.hdf5', 'a')
f.create_dataset('data0', data = np.zeros(10))
f.close()
f = h5py.File('test.hdf5', 'r')
print(f['data1'].value)
f.close()
  

RuntimeError:无法创建链接(名称已存在)

根据文档,数据应该连续存储,但我没有找到如何避免覆盖数据。

如何仅使用一个语句将数据存储在先前关闭的hdf5上?

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

如果你想在每次运行中创建一个唯一的文件,那么你应该考虑像这样命名文件,一个例子是将时间戳添加到文件的名称,一个非常简单的例子就是使用{{ 1}}模块和datetimenow方法来创建文件名。示例 -

strftime

然后您可以使用该文件名打开文件。

演示 -

import datetime
filename = "test_{}.hdf5".format(datetime.datetime.now().strftime("%Y_%m_%d_%H_%M_%S"))