我正在尝试将MATLAB实现转换为Python 3实现。我发现了一个我不理解的函数spdiags(),我也不确定如何将它翻译成Python 3。
关于该函数的MATLAB文档在这里: http://www.mathworks.com/help/matlab/ref/spdiags.html
关于同名函数的Scipy文档在这里: http://docs.scipy.org/doc/scipy/reference/generated/scipy.sparse.spdiags.html
MATLAB函数有什么作用,是否有相同返回值的Python实现?
答案 0 :(得分:3)
在Octave(MATLAB替代)中,其文档中的示例:
octave:7> x = spdiags (reshape (1:12, 4, 3), [-1 0 1], 5, 4);
octave:8> full(x) # display as a full or dense matrix
ans =
5 10 0 0
1 6 11 0
0 2 7 12
0 0 3 8
0 0 0 4
x
中存储的实际值为:
x =
Compressed Column Sparse (rows = 5, cols = 4, nnz = 11 [55%])
(1, 1) -> 5
(2, 1) -> 1
(1, 2) -> 10
(2, 2) -> 6
(3, 2) -> 2
(2, 3) -> 11
(3, 3) -> 7
(4, 3) -> 3
(3, 4) -> 12
(4, 4) -> 8
(5, 4) -> 4
等效的scipy.sparse
表达式:
In [294]: x = sparse.spdiags(np.arange(1,13).reshape(3,4), [-1, 0, 1], 5, 4)
In [295]: x.A # display as normal numpy array
Out[295]:
array([[ 5, 10, 0, 0],
[ 1, 6, 11, 0],
[ 0, 2, 7, 12],
[ 0, 0, 3, 8],
[ 0, 0, 0, 4]])
In [296]: x
Out[296]:
<5x4 sparse matrix of type '<class 'numpy.int32'>'
with 11 stored elements (3 diagonals) in DIAgonal format>
这使用dia
格式,但很容易使用csc
转换为x.tocsc()
(相当于Octave格式)。
要查看相同的坐标和值,我们可以使用dok
格式(字典子类):
In [299]: dict(x.todok())
Out[299]:
{(0, 1): 10,
(1, 2): 11,
(3, 2): 3,
(0, 0): 5,
(3, 3): 8,
(2, 1): 2,
(2, 3): 12,
(4, 3): 4,
(2, 2): 7,
(1, 0): 1,
(1, 1): 6}
相同的值,调整基于0的索引。
在这两种情况下,对角线值来自矩阵:
octave:10> reshape(1:12, 4, 3)
ans =
1 5 9
2 6 10
3 7 11
4 8 12
In [302]: np.arange(1,13).reshape(3,4)
Out[302]:
array([[ 1, 2, 3, 4],
[ 5, 6, 7, 8],
[ 9, 10, 11, 12]])
Octave / MATLAB按行排列值numpy
,因此排列reshape
。 numpy
矩阵是MATLAB等效矩阵的转置。
请注意,两者都省略了9
(映射到3个元素对角线的4个项目)。
另一个参数是要设置的对角线列表,[-1,0,1]
和最终形状(5,4)
。
论证中的大多数差异都必须在MATLAB和numpy之间做出基本的区别。另一个区别是MATLAB只有一个稀疏矩阵表示,scipy只有一半。
答案 1 :(得分:1)
嗯,这个答案只能划伤表面,但是:
对于矩阵,存在不同的存储格式。当然,有最直观的“一排一排”和“一列又一列”格式,但也有一些只有少数非零条目的矩阵格式,这当然可以节省大量内存(并且可以节省大量的内存) CPU)如果使用得当。
因此,这些对角稀疏矩阵就是matlab中特殊存储矩阵的情况;如果您不关心计算优势,只需使用diag
,它在功能上是100%等效的(但不生成稀疏矩阵)。
稀疏矩阵存储的存在是一个Matlab特性,而scipy实际上(我实际上对此感到惊讶)也有这个特性。如果符合您的需要,请使用scipy方法!
答案 2 :(得分:1)
对此我有一个解决方案,尝试起来非常简单,您会从MATLAB和python得到相同的答案,通过python,有时您必须更改输入格式。
所以尝试一下:
sparse.spdiags(your_Array.T, diags, m, n)