Question

我尝试在Rstudio服务器0.99.467和Revolution Analytics Open R 3.2.0（主要是带有一些额外软件包的标准R 3.2.0）中加载rJava并收到以下错误

> require(rJava)
Loading required package: rJava
Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
  call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
  error: unable to load shared object '/usr/lib64/RRO-3.2.0/R-3.2.0/lib64/R/library/rJava/libs/rJava.so':
  libjvm.so: cannot open shared object file: No such file or directory

我使用的是Centos 6.5和Oracle Java 1.8 JDK

[root@server ~]# java -version
java version "1.8.0_51"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.8.0_51-b16)
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 25.51-b03, mixed mode)

我已经搜索了问题，其中一个解决方案是将JAVA_HOME设置为空字符串，但我已将其设置为该值。

> Sys.getenv("JAVA_HOME")
[1] ""

如果可能是导致问题的原因，我还有两个库路径：

> .libPaths()
[1] "/home/kjedrzejewski/R/x86_64-unknown-linux-gnu-library/3.2"
[2] "/usr/lib64/RRO-3.2.0/R-3.2.0/lib64/R/library"

当我尝试在bash中以Rash加载此软件包时，不会出现此类错误。

Answer 1

当我以root身份运行命令时，一切都开始起作用了：

R CMD javareconf
rstudio-server verify-installation

我不确定到底有什么帮助。

在我的情况下，问题是由Rstudio（Sys.getenv('LD_LIBRARY_PATH')）访问的$ LD_LIBRARY_PATH指向的是与我使用的java版本不同的版本。

在Centos 6.5上的Rstudio服务器上加载rJava时出错

1 个答案: