目标:使用错误栏为单个点绘制非对称x误差线。我想显示数据集的四分位数范围(IQR)。
代码:
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
y = 1.0
data = np.random.rand(100)
median = np.median(data)
upper_quartile = np.percentile(data, 75)
lower_quartile = np.percentile(data, 25)
IQR = upper_quartile - lower_quartile
plt.errorbar(median, y, xerr=[lower_quartile ,upper_quartile], fmt='k--')
plt.savefig('IQR.eps')
plt.show()
错误:
Traceback (most recent call last):
File "IQR.py", line 15, in <module>
plt.errorbar(median, y, xerr=[0.5,0.75], fmt='k--')
File "/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/pyplot.py", line 2251, in errorbar
ret = ax.errorbar(x, y, yerr, xerr, fmt, ecolor, elinewidth, capsize, barsabove, lolims, uplims, xlolims, xuplims, **kwargs)
File "/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/axes.py", line 5327, in errorbar
in cbook.safezip(x,xerr)]
File "/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/cbook.py", line 1294, in safezip
raise ValueError(_safezip_msg % (Nx, i+1, len(arg)))
ValueError: In safezip, len(args[0])=1 but len(args[1])=2
我的问题是我无法为单个点创建非对称误差线,其中该点表示平均值,误差线的上限和下限将是上下四分位数。
答案 0 :(得分:8)
我通常会使用vlines
或hlines
(我认为上限只是让人分心):
plt.hlines( y, median-lower_quartile, median+upper_quartile)
plt.plot(median, y, 'o')
如果您仍想使用errorbar
,可以尝试
plt.errorbar(median, y, xerr=np.array([[lower_quartile ,upper_quartile]]).T,
fmt='ko')
请注意,我真的不知道你如何在这里定义四分位数,所以你可能需要确保你得到正确的数字!!!
答案 1 :(得分:0)
确保xerr获取列表列表。如果它只是一个列表,它将假设它包含两个Y的对称误差条。但是只有一个Y,这就是你得到错误的原因。
您的错误栏也是错误的。将错误栏调用更改为
plt.errorbar(median, y, xerr=[[median-lower_quartile ,upper_quartile-median]], fmt='k--')
答案 2 :(得分:-1)
您传递给safezip的两个论点有不同的大小。您发布的堆栈跟踪就在这里说:
ValueError: In safezip, len(args[0])=1 but len(args[1])=2
这说的是论证的长度是1,但是参数2的长度是2,所以zip实际上并不能合并这两个列表。