所以我有一个可见光图像和一组荧光显微图片,由2个通道组成,绿色和红色。
绿色通道信号发生在整个细胞体上。红色通道信号主要发生在细胞膜上。有4种可能的组合:没有信号的细胞,有红色和绿色信号的细胞,有红色信号的细胞和有绿色信号的细胞。
由于图像质量和分辨率较低,白色通道的分割会导致失败。绿色通道的分割更容易,因为简单的BW阈值可以为细胞提供良好的BW掩模。然而,红色通道图像更加棘手,我将在下面解释。从绿色和红色通道生成的BW图像附在下面以显示差异。
实验的目的是:1。用红色信号计数细胞数。 2如果电池有红色信号,请检查它是否有绿色信号。我不在乎没有红色信号的细胞。
但正如你在BW阈值处理后所看到的那样,红色信号有时会返回固体细胞;但更有可能返回一个空心圆形物体,而且通常是不完整的。有没有办法找出被圆形物体覆盖或可能被圆形物体覆盖的区域?因此,我可以在注册图像后找出该区域内的平均绿色通道强度。
我附上了original red channel file。非常感谢你的帮助!