rpy2的构建轮失败

Question

我在我的基本操作系统Freya 64位上运行Python v2.7.8和R v3.0.2 (2013-09-25) -- "Frisbee Sailing"（基于Ubuntu 14.04）。

我正在尝试使用以下代码安装rpy2包

pip install rpy2

并且失败并显示错误：

  

rpy2的构建轮失败

下面我也看到了：

  

错误：命令'gcc'因退出状态1而失败

完整输出为here。

我已经尝试过了：

sudo apt-get install python-dev libevent-dev python3-dev

但错误仍然存​​在。

我知道pip有效，因为我已经安装了numpy，matplotlib，scipy以及使用它的其他软件包。

Answer 1

在this post中找到答案。我只需将R从v3.0.2升级到我系统可用的最新版本（v3.2.1）。

步骤1：卸载以前的R-base安装

sudo apt-get remove r-base-core

第2步：更新Sources.List文件

1. 编辑sources.list文件

   sudo gedit /etc/apt/sources.list
   

2. 添加以下条目（ for Ubuntu 14.04 ）：

   deb http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu trusty/
   

第3步：添加公钥

gpg --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-key E084DAB9
gpg -a --export E084DAB9 | sudo apt-key add -

步骤4：安装R-base

sudo apt-get update
sudo apt-get upgrade
sudo apt-get install r-base

步骤5：安装rpy2

pip install rpy2

Answer 2

在完整输出中显示。

它与R的编译和/或安装方式有关。 Rpy2期待找不到的标题：

   ./rpy/rinterface/r_utils.c:32:31: fatal error: R_ext/Rallocators.h: No existe el archivo o el directorio
 #include <R_ext/Rallocators.h>

Answer 3

此解决方案对我有用，因为它实际上是标题问题：https://stackoverflow.com/a/23085474/7049567

sudo apt-get install libreadline-dev 

或

yum install readline-devel

Answer 4

apt-get install -y python3-rpy2