我有这个脚本
annotatepeaks.pl file mm9 -annStats filename > output
我使用这个脚本来运行一个作业:
annotatepeaks.pl file.xls mm9 -annStats file_stat.xls > file_ann.xls
由于我有多个文件并希望批量运行(添加Batchparallel.pl
)
Batchparallel.pl annotatepeaks.pl ann.xls mm9 -annStats filename -f *.xls
基本上为一个作业运行并行命令。问题是-annStats
只给我一个输出文件。如何指定文件名以使其获取输入名称并将其用于该特定标志(-annStats
)的输出。
我对此非常陌生,所以希望我的问题对每个人都有意义。
感谢您的帮助!