如何使用默认R安装通过conda安装rpy2

时间:2015-07-13 19:53:58

标签: linux r python-2.7 anaconda rpy2

我在Ubuntu linux上使用Anaconda Python发行版,并希望在IPython笔记本中使用R magics。有没有办法用conda发行版安装rpy2并在/ usr / bin / R使用我当前的默认R安装?我的目标是保持当前的R安装,而无需通过conda安装R或其他R软件包。

这个response to a related question建议在mac上使用配方,但对我不起作用:

conda skeleton pypi rpy2
conda build rpy2
conda install rpy2 --use-local

构建命令产生以下错误:

Error: No packages found in current linux-64 channels matching:  singledispatch

我可以通过binstar安装singledispatch:

conda install -c https://conda.binstar.org/asmeurer singledispatch

conda list | grep "singledispatch"
singledispatch            3.4.0.3                  py27_1

但是我得到了与当前linux-64频道中没有找到包的错误相同的错误。

1 个答案:

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我有一个类似的问题,包没有安装在适当的地方,我建议改为使用apt而不是conda

sudo apt install python-rpy2

编辑: *注意rpy2的官方支持已经停止为2.7 *