Question

我在boot中使用R函数来实现bootstrap。我的问题是如何设置boot来利用其并行选项。考虑以下估算中位数的具体例子。

med_est <- function(dat, indices){
    .dat <- dat[indices]
    median(.dat)
}
dat <- rnorm(200)
system.time(boot(dat, med_est, R = 10000))
system.time(boot(dat, med_est, R = 10000, parallel = "multicore"))

我不知道如何在parallel函数中使用boot选项。让parallel = "multicore"不会提高速度。我尝试过更复杂的估算问题。但我没有看到差异。所以我想我没有正确使用boot。我的机器是双核Mac。

Answer 1

来自boot手册（粗体是我的）。

启动（数据，统计，R，SIM =＆＃34;普通＆＃34;，stype = c（＆＃34;我＆＃34;，＆＃34; f＆＃34;，＆＃34; w＆＃ 34）， strata = rep（1，n），L = NULL，m = 0，权重= NULL， ran.gen = function（d，p）d，mle = NULL，simple = FALSE，...， parallel = c（＆＃34; no＆＃34;，＆＃34; multicore＆＃34;，＆＃34; snow＆＃34;）， ncpus = getOption（＆＃34; boot.ncpus＆＃34;，1L），cl = NULL）

尝试：

system.time(boot(dat, med_est, R = 10000, parallel = "multicore", ncpus=2))

在`R`

1 个答案: