Question

我是R markdown和knitr的新手，并没有找到这个问题的答案：

我有R脚本，我编写了函数并将数据分配给位置1（.GlobalEnv）。如何在R markdown中访问我的数据并运行我的函数并使用knitr生成.html文件？

这是一个简单的例子。在脚本文件中，我生成：

some.x.data<-1:10
some.y.data<-1:10
toy.fn<-function(){
  tot<-some.x.data + some.y.data
  tot
}

toy.fn（）在脚本文件中有效。

我的R降价文件包含：

---
title: "trivial test"
author: "me"
date: "July 9, 2015"
output: html_document
---


```{r}
plot(some.x.data, some.y.data)
toy.fn()
```

当我点击编织HTML时，我收到以下错误：

绘图错误（some.x.data，some.y.data）：找不到对象'some.x.data' 呼叫：... withCallingHandlers - ＆gt; withVisible - ＆gt; eval - ＆gt; eval - ＆gt;积

由于

Answer 1

RStudio打开一个新的knit() Rmd文件的R会话，因此.GlobalEnv中的对象将无法用于该会话（它们是两个单独的会话），所以当你knitr HTML some.x.data无法知道some.y.data，toy.fn和Rmd是什么。

您需要在```{r, echo = FALSE, message = FALSE} some.x.data<-1:10 some.y.data<-1:10 toy.fn<-function(){ tot<-some.x.data + some.y.data tot } ```文件中重新创建它们。如果您不想要任何输出，请执行以下操作：

Rmd

完整--- title: "trivial test" author: "me" date: "July 9, 2015" output: html_document --- ```{r, echo = FALSE, message = FALSE} some.x.data<-1:10 some.y.data<-1:10 toy.fn<-function(){ tot<-some.x.data + some.y.data tot } ``` ```{r} plot(some.x.data, some.y.data) toy.fn() ```：

knit

或

自己手动
library(knitr); knit('your_file.Rmd')：deployment-target

使用r markdown和knitr访问R脚本生成的数据

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