最佳/更标准的图形表示文件格式？ （GraphSON，Gexf，GraphML？）

Question

标准图形表示文件格式或最常用的格式是什么？ 我会说这三个中的一个：

• GraphSON
• GEXF
• GraphML

但是，如果有人能指出每个人的优点/缺点，那将会很棒。

Answer 1

答案最终取决于问题的大小以及您想要实现的目标。

例如，这些格式都不能处理数十亿个顶点，而某些专用的大型图形分析框架（如Spark或GraphLab-Create）可以处理。

GraphML和GEXF大致相同，都是基于XML的。 GraphML是标准的，并且支持很多图形库，例如NetworkX，igraph，Boost Graph Library，Graph-tool，JGraphT，Gephi。 GraphSon不受欢迎。

要绘制GraphML或GEXF图表，您可以使用Gephi或Tulip（仅限GEXF）。

Answer 2

我认为JGF也是一个很好的候选人。

我对最近的一个项目进行了很多评估，并且这个项目名列前茅。具体来说，我喜欢：

• 解析并生成
的小事
• 能够为任何节点，边缘或图形包含任意额外数据。
• 指定良好，可由多个现有项目解析。

http://jsongraphformat.info/

https://github.com/jsongraph/json-graph-specification

Answer 3

理想情况下，您需要主要第三方软件支持的内容。我目前正在考虑导出到Gephi，它支持：

• GEXF
• GDF
• GML
• GraphML
• Pajek NET
• GraphViz DOT
• CSV
• UCINET DL
• Tulip TPL
• Netdraw VNA

我很乐意看到对每种格式的好处的分析。 Gephi的sample datasets包括很多GEXF和GML。

Answer 4

GNU Bison输出Graphviz DOT文件以帮助可视化解析器自动机，自动机通常是非常大的图。在这里您可以找到small sample。

我认为DOT至少对于开源项目来说是事实上的标准，也是因为有许多出色的开源工具可以从DOT文件生成图像（例如dot，neato，sfdp）。

目前，Gephi和Tulip并未绘制边缘标签，这对于某些应用程序可能是个问题。