Question

我想在没有互联网连接的Windows 7计算机上使用packrat。我已将http://cran.r-project.org/bin/windows/contrib/3.1/的所有二进制包下载到本地文件夹C:/xyz/CRAN_3_1。

现在的问题是

packrat::init(options=list(local.repos="C:/xyz/CRAN_3_1"))

抛出一堆警告和错误，如

Warning: unable to access index for repository http://cran.rstudio/bin/...
Warning: unable to access index for repository http://cran.rstudio/src/...
Fetching sources for Rcpp (0.11.4) ... Failed
Package Rcpp not available in repository or locally

似乎packrat试图找到

CRAN上的Rcpp二进制版本（因为没有互联网连接而失败）
CRAN上Rcpp的来源（由于没有互联网连接而失败）
包的本地源（因为我只有二进制文件而失败）

我不明白为什么packrat也不会搜索本地 二进制包...

问题1：我可以下载源CRAN存储库来解决此问题。但我想告诉大家，是否有一个更简单的解决方案，即，是否有可能使packrat接受本地二进制仓库。

问题2 ：当我在启用了packrat的情况下创建自己的包myPackage时，包中还会包含myPackage特定的本地packrat库？也就是说，假设我将二进制myPackage zip文件提供给我的一位没有myPackage所依赖的软件包的同事（让我们说Rcpp）。当我使用Rcpp时，myPackage会包含packrat吗？或者我的同事是否必须自己安装Rcpp？

Answer 1

我设法解决了这个问题。请记住，我以前从未使用过packrat而且我不知道它的＃34;正确的＆＃34;行为。但我的印象是黑客行事。我是这样做的：

打开您的项目，通过packrat

library(packrat)

键入fixInNamespace("snapshotImpl",ns="packrat") - 打开一个窗口 - 将其内容复制到剪贴板
转到/yourProjDir/并创建文件snapshotImplFix.R
将剪贴板的内容复制到此文件中......
...但是将第一行更改为

snapshotImplFix=function (project, available = NULL, lib.loc = libDir(project), dry.run = FALSE, ignore.stale = FALSE, prompt = interactive(), auto.snapshot = FALSE, verbose = TRUE, fallback.ok = FALSE, snapshot.sources = FALSE)

注意snapshot.sources = FALSE！保存并关闭文件。
创建/yourProjDir/.Rprofile并添加

setHook(packageEvent("packrat","onLoad"),function(...) { source("./snapshotImplFix.R"); tmpfun=get("snapshotImpl",envir=asNamespace("packrat")); environment(snapshotImplFix)=environment(tmpfun); utils::assignInNamespace(x="snapshotImpl",value=snapshotImplFix,ns="packrat");})

点2-6修复了snapshot.sources参数默认为TRUE的问题（我没有找到更好的方法来改变它......）
最后，我们必须告诉packrat带我们的本地存储库。拥有正确的文件夹结构非常重要。因此，我将回购从C:/xyz/CRAN_3_1移至C:/xyz/CRAN_3_1/bin/windows/contrib/3.1。如果您还需要移动文件，请不要忘记运行library(tools);write_PACKAGES("C:/xyz/CRAN_3_1/bin/windows/contrib/3.1");。
再次打开yourProjDir/.Rprofile并在最后添加

local({r=getOption("repos");r["CRAN"]="file:///C:/xyz/CRAN_3_1";r["CRANextra"]=r["CRAN"];options(repos=r)})

请注意/之后的3 file！保存并退出文件。
关闭项目并重新打开。
现在您可以执行packrat::init()，它应该可以正常运行。

如果对packrat有更多经验的人能够提供他/她的输入以便我确信这个黑客行之有效，那就太棒了。当然，任何指向正确解决方案的指针都非常受欢迎。

Packrat与本地二进制存储库

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