使用packrat包的Makefile

时间:2017-11-24 19:37:33

标签: r makefile packrat

我第一次在项目中使用packrat包,我想使用Makefile以特定顺序为不同的目标运行特定脚本。然而。我像这样组织了我的文件:

  • main_dir/packrat/
  • main_dir/subproject1/R_scripts_1/Makefile

当我从Makefile中运行R CMD BATCH someRfile.R时,R不使用packrat libs,而是使用默认用户libs,这不是我想要的。 有没有办法强制所有R进程startet在packrat目录的任何子目录中,只使用packrat库?!

谢谢!

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

我想您必须在source("packrat/init.R")的最开头包含someRfile.R,就像项目文件夹中的.Rprofile文件一样。

我假设您在上述评论中使用了R studio。

答案 1 :(得分:1)

刚出现这个问题 - 以下修正了它。

向包含以下内容的每个子目录(和子子目录等)添加.Rprofile

source("../.Rprofile", chdir = TRUE)

来自packrat docs