我的问题是我有一个非常大的时间序列(约5-10百万个障碍物),其中某些事件标有标记。在这种情况下,如果事件被触发,则触发具有虚拟变量的事件的股票价格下降是1或0。从这个时间序列我想提取事件本身和随后的29天数据。显然,这涉及某种类型的数组拼接。
我有一些简单的代码应该做的伎俩(它只标记标志,接下来的29天为2,但从那里过滤数据帧很简单)但它依赖于pandas数据帧拼接,这不是很快。这是代码:
def first_drop(df):
indexlen = len(df.dropflag[df.dropflag==1].index)
for y in range(indexlen):
x = df.dropflag[df.dropflag==1].index[y]
df.dropflag[x:30]=2
return df.dropflag
dstk['dropflag2'] = dstk[["permno","dropflag"]].groupby('permno').apply(first_drop)
在获得下一个x条目的情况下,是否有其他人找到更快的方法来进行此类拼接?我认为它可能更快与numpy数组或可能是一个cythonized函数,但我不知道从哪里开始。
答案 0 :(得分:2)
这是一种可行的方法。也许不是那么快,处理10,000,000行数据集需要1分钟。我们的想法是,通过使用.shift(-i)
在后续日期使用数据填充新列,可以避免在每个groupby
内循环行。它的优点是可以灵活地重新生成结果数据帧,例如stack()
来获取堆叠记录。
import pandas as pd
import numpy as np
# generate some artificial data, 10,000,000 rows
# ============================================================
np.random.seed(0)
dates = pd.date_range('2001-01-01', periods=2500, freq='B')
permno = np.arange(1000, 5000) # 4000 symbols
multi_index = pd.MultiIndex.from_product([permno, dates], names=['permno', 'dates'])
data = np.random.randn(10000000)
dropflag = np.random.choice([0,1], size=10000000)
df = pd.DataFrame({'data': data, 'dropflag': dropflag}, index=multi_index).reset_index('permno')
Out[273]:
permno data dropflag
dates
2001-01-01 1000 1.7641 1
2001-01-02 1000 0.4002 1
2001-01-03 1000 0.9787 0
2001-01-04 1000 2.2409 1
2001-01-05 1000 1.8676 0
... ... ... ...
2010-07-26 4999 0.5902 1
2010-07-27 4999 0.4676 1
2010-07-28 4999 -1.9447 1
2010-07-29 4999 -0.3440 1
2010-07-30 4999 -0.7402 0
[10000000 rows x 3 columns]
# processing
# ============================================================
def func(group):
all_data = [group]
for i in np.arange(1, 30):
temp = group.data.shift(-i)
temp.name = 'data_subday{}'.format(i)
all_data.append(temp)
dataset = pd.concat(all_data, axis=1).iloc[:-30]
return dataset.loc[dataset.dropflag==1]
%time df.groupby('permno').apply(func)
CPU times: user 59.7 s, sys: 1.83 s, total: 1min 1s
Wall time: 1min 5s
Out[277]:
permno data dropflag data_subday1 data_subday2 ... data_subday25 data_subday26 data_subday27 data_subday28 data_subday29
permno dates ...
1000 2001-01-01 1000 1.7641 1 0.4002 0.9787 ... -1.4544 0.0458 -0.1872 1.5328 1.4694
2001-01-02 1000 0.4002 1 0.9787 2.2409 ... 0.0458 -0.1872 1.5328 1.4694 0.1549
2001-01-04 1000 2.2409 1 1.8676 -0.9773 ... 1.5328 1.4694 0.1549 0.3782 -0.8878
2001-01-08 1000 -0.9773 1 0.9501 -0.1514 ... 0.1549 0.3782 -0.8878 -1.9808 -0.3479
2001-01-09 1000 0.9501 1 -0.1514 -0.1032 ... 0.3782 -0.8878 -1.9808 -0.3479 0.1563
... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
4999 2010-06-09 4999 2.1195 1 1.5564 1.0739 ... 0.2677 1.2637 -0.3607 -1.4011 1.1292
2010-06-15 4999 -1.1747 1 0.2159 0.1221 ... 1.1292 1.1614 0.4842 1.3593 0.5902
2010-06-16 4999 0.2159 1 0.1221 0.0136 ... 1.1614 0.4842 1.3593 0.5902 0.4676
2010-06-17 4999 0.1221 1 0.0136 0.8378 ... 0.4842 1.3593 0.5902 0.4676 -1.9447
2010-06-18 4999 0.0136 1 0.8378 0.4887 ... 1.3593 0.5902 0.4676 -1.9447 -0.3440
[4941409 rows x 32 columns]