如何在CCA图中更改样本标签

Question

通过使用vegan包，我绘制了一个CCA图。我已将envi文件中的第一列添加为样本名称。但是，图中的样本被标记为默认值，例如row1,row2,....。我想将样本的标签更改为我的表中列出的特定样本，例如Jan.S1,Jan.S2,.....。我该如何更改标签？另外，如何更改这些标签的位置以避免与点重叠？

在这里，我附上了我的代码如下：

speciesdata=read.csv("species.csv", header=T, sep=",") 
envdata= read.csv("envi.csv", header=T, sep=",")
Miseq.cca=cca(speciesdata ~ TN + TP + NH4  + pH + Zn + Pb + Cd + Ni + Cr, data = envdata)
Miseq.cca
plot(Miseq.cca,display=c("si","bp"),scaling=3)

Answer 1

您可以使用参数＆＃34; row.names = 1＆＃34;。这将使R假设csv表的第一列是样本名称，而不是数据。

例： 1）Put＆＃34; Jan.S1，Jan.S2，.....＆＃34;在species.csv文件的第一列。 2）使用＆＃34; speciesdata = read.csv（＆＃34; species.csv＆＃34;，header = T，sep =＆＃34;，＆＃34;，row.names = 1）＆＃34;在R脚本上。