我在Fortran代码中收到以下错误:
Program received signal SIGSEGV: Segmentation fault - invalid memory reference.
Backtrace for this error:
#0 0x7F80C7B46777
#1 0x7F80C7B46D7E
#2 0x7F80C7282D3F
#3 0x402D1A in __mymodule_MOD_gcr_mfree
#4 0x412175 in MAIN__ at HUHSI1.f90:?
Segmentation fault (core dumped)
------------------
(program exited with code: 139)
我完全不明白这个错误。这是什么错误?
数字3表示以下子程序:
SUBROUTINE gcr_Mfree(F2,Cnew,Cold,C_Fold,xm,converged)
!**** FUNCTIONS TO BE SOLVED ****
! Generalized Conjugate Residual Algorithm
! Solves M*x=b (J*dx=-F)
IMPLICIT REAL*8 (A-H,O-Z)
INTEGER, intent(out) :: converged
REAL*8, DIMENSION(:,:), ALLOCATABLE :: F2,p,Mp
REAL*8, DIMENSION(:), ALLOCATABLE :: F2V,F22V,CnewV,ColdV,C_FoldV,alpha2,r,b,Mr,xv
! 2D INPUT VARIABLE DIMENSIONS:
DIMENSION F22(-2:IG+2,-2:JG+2)
DIMENSION Cnew(-2:IG+2,-2:JG+2)
DIMENSION Cold(-2:IG+2,-2:JG+2)
DIMENSION C_Fold(-2:IG+2,-2:JG+2)
DIMENSION xm(-2:IG+2,-2:JG+2)
integer :: j,maxiter,iter
real*8 :: tol,normr
!===================================================================
MASK = SIZE(F2) ! Size of F2 : (IG+5)*(JG+5)
Print*, 'MASK IS EQUAL TO',MASK
ALLOCATE(F2V(1:MASK))
ALLOCATE(CnewV(1:MASK))
ALLOCATE(ColdV(1:MASK))
ALLOCATE(C_FoldV(1:MASK))
ALLOCATE(xv(1:MASK))
ALLOCATE(r(1:MASK))
ALLOCATE(b(1:MASK))
ALLOCATE(p(1:IG,1:JG))
ALLOCATE(Mp(1:IG,1:JG))
!************* RESHAPING MATRICES TO VECTORS **************
F2V = RESHAPE(F2 ,(/MASK/))
ColdV = RESHAPE(Cold ,(/MASK/))
CnewV = RESHAPE(Cnew ,(/MASK/))
C_FoldV = RESHAPE(C_Fold,(/MASK/))
! Write(*,*) shape(CnewV), shape(Cnew)
! WRITE(*,*) 'Cold='
! WRITE(*,554) Cold
! WRITE(*,*) 'Cnew='
! WRITE(*,554) Cnew
!554 FORMAT(F4.2,1X,F4.2,1X,F4.2,1X,F4.2,1X,F4.2,1X,F4.2,1X,F4.2,1X,F4.2,1X,F4.2,1X,F4.2,1X,F4.2,1X,F5.3,1X,F5.3,1X)
b = -F2V(1:MASK) !(why minus?)
tol = 5.E-2
alpha2 = 1e-6
maxiter = MASK
r = b(1:MASK) ! we need this when calculating r_new
normr = sqrt(sum( r(:)**2 )) !!!! Norm
557 FORMAT(1X,F5.2,2X,F5.2,10X,F5.2,4X,F5.2,10X,F5.2,2X,F5.2)
WRITE(*,*) 'ColdV,CnewV'
WRITE(*,557) ColdV,CnewV,F2V,C_FoldV,b,r
PRINT*, 'normr=', nomr
!************* MAIN CALCULATION ****************
DO iter=1,maxiter
!Get preliminary search direction
p(:,iter) = r(:)
WRITE(*,*) 'p='
WRITE(*,558) ,p
558 FORMAT(1X,F4.2)
! Approximate the Jacobian(M) residual product
CnewV = CnewV + alpha2 * r
WRITE(*,*), 'CnewV='
WRITE(*,559) ,CnewV
559 FORMAT(1X,F4.2)
Cnew = RESHAPE(CnewV,(/IG+5,JG+5/))
!********** Call Crank-Nicolson Function
F22V= RESHAPE(F22,(/MASK/))
Mr(:) = (1/alpha2)*(F22V-F2V) !GUIDE: (The apporximated Jacobian matrix)
Mp(:,iter) = Mr(:)
!! Orthogonalize search direction
do j = 1, iter-1
p(:,iter) = p(:,iter) - sum( Mp(:,j) * Mp(:,iter) ) * p(:,j)
Mp(:,iter) = Mp(:,iter) - sum( Mp(:,j) * Mp(:,iter) ) * Mp(:,j)
enddo
!Normalize search direction
p(:,iter) = p(:,iter) / (norm2(Mp(:,iter)))
Mp(:,iter) = Mp(:,iter) / (norm2(Mp(:,iter)))
!Update solution and residual
alpha2 = sum( r(:) * Mp(:,iter) ) / sum( Mp(:,iter)**2 )
xv = xv + alpha2 * p(:,iter)
r = r - alpha2 * Mp(:,iter) ! where is the *(Cnew - C)?
xm = RESHAPE(xv,(/IG+5,JG+5/))
!Check convergence
normr=sqrt(sum( r(:)**2 )) !!!! norm
!fprintf('norm(r) = !g iter = !gNewLine',normr,iter+1);
if (normr.LT.tol) then
converged=1
exit
end if
END DO
if (normr > tol) then
write(*,*) 'GCR SOLUTION DID NOT CONVERGE!'
converged=0
end if
RETURN
END subroutine gcr_Mfree
我已经做了几件事来弄清楚为什么我收到这个错误:
我通过逐步打印来跟踪代码中变量的值。我已经达到了这个公式,我无法打印 CnewV 的值。
CnewV = CnewV + alpha2 * r
此公式位于“mymodule_MOD_gcr_mfree”中,在错误消息中由#3表示。 为什么错误没有显示任何行号?
“r”是一个向量。 “alpha2”是标量。 RHS的CnewV是一个向量。 “r”和“CnewV”的大小和等级是相同的,并且“CnewV”向量中仅一个元素的值是 NaN 。此外,当我尝试在屏幕上打印时,会打印两个或三个元素“*****”。
当打印矩阵“p”(格式编号为558)时,阵列p中的元素要少得多。数组“r”中有221个元素,但“p”
这是一个复杂的问题。我希望给出的信息足以理解错误。
答案 0 :(得分:2)
您超出了p
和Mp
的数组边界,这些数据范围的大小均为(1:IG,1:JG)
。 iter的外部循环从1运行到maxiter=MASK=(IG+5)*(JG+5)
,最终导致p(:,iter)
的非法内存访问。这一行
p(:,iter)=r(:)
是不匹配的,因为r
的大小= MASK。
答案 1 :(得分:-1)
问题1的答案: 分段错误是由于内存冲突造成的。在这种情况下,由于错误的变量分配而产生错误。另外,我们应该设置变量限制。
错误:
CnewV(0:IG,0:JG) = CnewV(0:IG,0:JG) + alpha2 * r(0:IG,0:JG)
更正:
program ptrtest
real, pointer, CONTIGUOUS :: Mr(:)
real, pointer, CONTIGUOUS :: Mp(:,:)
real, DIMENSION(9) ::abc
integer :: n = 2
iter=3
Do i=1,iter
alpha2 = 2
allocate(Mr(n**2))
abc= 42
Mr(1:n**2) = 0.5 * abc(1:n**2)
write(*,*) 'Mr='
write(*,555) Mr
Mr(1:n**2) => Mp(1:n**2,1:1)
WRITE(*,*) 'Mp='
WRITE(*,555) Mp
end do
555 FORMAT(F12.4,1X)
end program ptrtest
问题2的答案: 我相信这是一个编译错误。我也检查了其他编译器,没有人能够解决这种类型的错误。
问题3的答案: 函数/子例程内的数组中元素数量较少是由于在调用函数/子例程期间设置不正确。如果出现此错误,则应将该变量添加到应调用的变量列表中。
Still Pointer assignemnt无法正常工作: 我设法克服了分段错误,整个代码编译得很好。但是,我在第3次迭代后收到NaN号码。
以下测试代码旨在显示问题的根源。我尝试了以下解决方案。但是,我无法写出矢量' Mr'到目标矩阵' Mp'的列在每次迭代!
gfortran -Wall -fcheck=all "Pointer.f95" (in directory: /home/vahid/Dropbox/To Move folder/Geany/Test_Pointer application)
Pointer.f95:25.3:
Mr(1:n**2) => Mp(1:n**2,1:i)
1
Error: Incompatible ranks 1 and 2 in assignment at (1)
Compilation failed.
错误:
Mp(1:n**2,1:i) => Mr(1:n**2)
我试过了Equipment
。这克服了编译错误。但是,Mp不是目标,并且在每次迭代时,向量的元素被重写为矩阵的第1列。