R：lattice.qq如何进行治疗[x]与对照的多面板图？

Question

我有一个如下所示的数据框：

str(Data)
'data.frame':   11520 obs. of  29 variables:
 $ groupname  : Factor w/ 8 levels "Control","Treatment1",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
 $ fCycle     : Factor w/ 2 levels "Dark","Light": 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 ...
 $ totdist    : num  0 67.5 89.8 109.1 58.3 ...
 #etc.

我可以像这样做一个治疗1对比控制的情节：

qq(groupname~totdist|fCycle, data=Data, 
 subset=(groupname=='Control'|groupname=='Treatment1'))

看起来像这样：

我想自动制作类似治疗2对比控制的图...治疗X对照。这是一个循环的地方还是格子有更好的方法？

Answer 1

要在单个面板上执行此操作需要重新安排。首先，我将生成一个与您的结构相同的样本数据集

library(lattice)
Data <- data.frame(groupname = factor(rep(c('Control',paste('Treatment',1:7,sep='')),each = 100)),
                   fCycle = factor(rep(rep(c('Dark','Light'),each = 50),8)),
                   totdist = sample(unlist(iris),800,replace = TRUE))

接下来，添加一个变量来区分治疗和控制（即"Treatment2"被重新编码为"Treatment"等。）

Data$groupname2 <- factor(gsub('[1-9]','',as.character(Data$groupname)))

然后重新排列数据集，以便为每个治疗组提供控制数据的副本

Data2 <- NULL
for(treat in paste('Treatment',1:7,sep='')){
  Data2 <- rbind(Data2,
                 cbind(rbind(Data[Data$groupname == treat,],Data[Data$groupname == 'Control',]),
                       treat))
}

最后，我们可以制作所需的图表

qq(groupname2~totdist|fCycle*treat, data=Data2)

如果你想为每个治疗分别绘制一个图，那么循环会更好

pdf('treatVsContQq.pdf')
for(treat in paste('Treatment',1:7,sep='')){
  print(qq(groupname~totdist|fCycle, data=Data,
     subset=(groupname=='Control'|groupname==treat)))
}
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